Protein–RNA interactions for Protein: Q96IQ7

VSIG2, V-set and immunoglobulin domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 327 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VSIG2Q96IQ7 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
VSIG2Q96IQ7 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
VSIG2Q96IQ7 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
VSIG2Q96IQ7 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
VSIG2Q96IQ7 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
VSIG2Q96IQ7 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
VSIG2Q96IQ7 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
VSIG2Q96IQ7 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
VSIG2Q96IQ7 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
VSIG2Q96IQ7 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
VSIG2Q96IQ7 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
VSIG2Q96IQ7 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
VSIG2Q96IQ7 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
VSIG2Q96IQ7 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
VSIG2Q96IQ7 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
VSIG2Q96IQ7 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
VSIG2Q96IQ7 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
VSIG2Q96IQ7 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
VSIG2Q96IQ7 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
VSIG2Q96IQ7 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
VSIG2Q96IQ7 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
VSIG2Q96IQ7 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
VSIG2Q96IQ7 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
VSIG2Q96IQ7 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
VSIG2Q96IQ7 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
VSIG2Q96IQ7 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
VSIG2Q96IQ7 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
VSIG2Q96IQ7 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
VSIG2Q96IQ7 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
VSIG2Q96IQ7 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
VSIG2Q96IQ7 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
VSIG2Q96IQ7 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
VSIG2Q96IQ7 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
VSIG2Q96IQ7 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
VSIG2Q96IQ7 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
VSIG2Q96IQ7 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
VSIG2Q96IQ7 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
VSIG2Q96IQ7 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
VSIG2Q96IQ7 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
VSIG2Q96IQ7 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
VSIG2Q96IQ7 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
VSIG2Q96IQ7 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
VSIG2Q96IQ7 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
VSIG2Q96IQ7 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
VSIG2Q96IQ7 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
VSIG2Q96IQ7 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
VSIG2Q96IQ7 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
VSIG2Q96IQ7 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
VSIG2Q96IQ7 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
VSIG2Q96IQ7 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
VSIG2Q96IQ7 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
VSIG2Q96IQ7 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
VSIG2Q96IQ7 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
VSIG2Q96IQ7 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
VSIG2Q96IQ7 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
VSIG2Q96IQ7 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
VSIG2Q96IQ7 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
VSIG2Q96IQ7 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
VSIG2Q96IQ7 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
VSIG2Q96IQ7 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
VSIG2Q96IQ7 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
VSIG2Q96IQ7 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
VSIG2Q96IQ7 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
VSIG2Q96IQ7 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
VSIG2Q96IQ7 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
VSIG2Q96IQ7 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
VSIG2Q96IQ7 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
VSIG2Q96IQ7 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
VSIG2Q96IQ7 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
VSIG2Q96IQ7 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
VSIG2Q96IQ7 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
VSIG2Q96IQ7 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
VSIG2Q96IQ7 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
VSIG2Q96IQ7 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
VSIG2Q96IQ7 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
VSIG2Q96IQ7 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
VSIG2Q96IQ7 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
VSIG2Q96IQ7 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
VSIG2Q96IQ7 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
VSIG2Q96IQ7 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
VSIG2Q96IQ7 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
VSIG2Q96IQ7 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
VSIG2Q96IQ7 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
VSIG2Q96IQ7 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
VSIG2Q96IQ7 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
VSIG2Q96IQ7 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
VSIG2Q96IQ7 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
VSIG2Q96IQ7 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
VSIG2Q96IQ7 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
VSIG2Q96IQ7 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
VSIG2Q96IQ7 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
VSIG2Q96IQ7 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
VSIG2Q96IQ7 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
VSIG2Q96IQ7 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
VSIG2Q96IQ7 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
VSIG2Q96IQ7 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
VSIG2Q96IQ7 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
VSIG2Q96IQ7 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
VSIG2Q96IQ7 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
VSIG2Q96IQ7 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms