Protein–RNA interactions for Protein: Q96GD3

SCMH1, Polycomb protein SCMH1, humanhuman

Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCMH1Q96GD3 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SCMH1Q96GD3 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SCMH1Q96GD3 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
SCMH1Q96GD3 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
SCMH1Q96GD3 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SCMH1Q96GD3 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SCMH1Q96GD3 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SCMH1Q96GD3 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SCMH1Q96GD3 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SCMH1Q96GD3 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SCMH1Q96GD3 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
SCMH1Q96GD3 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
SCMH1Q96GD3 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SCMH1Q96GD3 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SCMH1Q96GD3 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SCMH1Q96GD3 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SCMH1Q96GD3 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
SCMH1Q96GD3 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SCMH1Q96GD3 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SCMH1Q96GD3 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SCMH1Q96GD3 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SCMH1Q96GD3 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SCMH1Q96GD3 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SCMH1Q96GD3 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SCMH1Q96GD3 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SCMH1Q96GD3 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SCMH1Q96GD3 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SCMH1Q96GD3 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SCMH1Q96GD3 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
SCMH1Q96GD3 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SCMH1Q96GD3 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SCMH1Q96GD3 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SCMH1Q96GD3 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SCMH1Q96GD3 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SCMH1Q96GD3 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SCMH1Q96GD3 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SCMH1Q96GD3 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SCMH1Q96GD3 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SCMH1Q96GD3 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SCMH1Q96GD3 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SCMH1Q96GD3 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SCMH1Q96GD3 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SCMH1Q96GD3 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SCMH1Q96GD3 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SCMH1Q96GD3 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SCMH1Q96GD3 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SCMH1Q96GD3 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SCMH1Q96GD3 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SCMH1Q96GD3 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SCMH1Q96GD3 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SCMH1Q96GD3 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SCMH1Q96GD3 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
SCMH1Q96GD3 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SCMH1Q96GD3 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SCMH1Q96GD3 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SCMH1Q96GD3 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SCMH1Q96GD3 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
SCMH1Q96GD3 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SCMH1Q96GD3 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SCMH1Q96GD3 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SCMH1Q96GD3 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
SCMH1Q96GD3 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SCMH1Q96GD3 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SCMH1Q96GD3 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SCMH1Q96GD3 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SCMH1Q96GD3 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SCMH1Q96GD3 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SCMH1Q96GD3 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SCMH1Q96GD3 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SCMH1Q96GD3 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SCMH1Q96GD3 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SCMH1Q96GD3 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SCMH1Q96GD3 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SCMH1Q96GD3 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SCMH1Q96GD3 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SCMH1Q96GD3 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SCMH1Q96GD3 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SCMH1Q96GD3 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SCMH1Q96GD3 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SCMH1Q96GD3 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SCMH1Q96GD3 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SCMH1Q96GD3 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SCMH1Q96GD3 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SCMH1Q96GD3 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SCMH1Q96GD3 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SCMH1Q96GD3 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SCMH1Q96GD3 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SCMH1Q96GD3 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SCMH1Q96GD3 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SCMH1Q96GD3 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SCMH1Q96GD3 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SCMH1Q96GD3 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
SCMH1Q96GD3 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
SCMH1Q96GD3 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
SCMH1Q96GD3 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
SCMH1Q96GD3 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
SCMH1Q96GD3 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
SCMH1Q96GD3 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
SCMH1Q96GD3 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SCMH1Q96GD3 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.9 ms