Protein–RNA interactions for Protein: Q96ET8

TVP23C, Golgi apparatus membrane protein TVP23 homolog C, humanhuman

Predictions only

Length 276 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TVP23CQ96ET8 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TVP23CQ96ET8 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TVP23CQ96ET8 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TVP23CQ96ET8 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
TVP23CQ96ET8 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TVP23CQ96ET8 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TVP23CQ96ET8 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TVP23CQ96ET8 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TVP23CQ96ET8 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TVP23CQ96ET8 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TVP23CQ96ET8 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TVP23CQ96ET8 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TVP23CQ96ET8 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TVP23CQ96ET8 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TVP23CQ96ET8 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TVP23CQ96ET8 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TVP23CQ96ET8 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TVP23CQ96ET8 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TVP23CQ96ET8 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TVP23CQ96ET8 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TVP23CQ96ET8 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TVP23CQ96ET8 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TVP23CQ96ET8 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TVP23CQ96ET8 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TVP23CQ96ET8 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TVP23CQ96ET8 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TVP23CQ96ET8 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TVP23CQ96ET8 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TVP23CQ96ET8 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TVP23CQ96ET8 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TVP23CQ96ET8 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TVP23CQ96ET8 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TVP23CQ96ET8 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TVP23CQ96ET8 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TVP23CQ96ET8 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TVP23CQ96ET8 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TVP23CQ96ET8 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TVP23CQ96ET8 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TVP23CQ96ET8 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TVP23CQ96ET8 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TVP23CQ96ET8 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TVP23CQ96ET8 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TVP23CQ96ET8 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TVP23CQ96ET8 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TVP23CQ96ET8 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TVP23CQ96ET8 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TVP23CQ96ET8 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TVP23CQ96ET8 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TVP23CQ96ET8 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TVP23CQ96ET8 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TVP23CQ96ET8 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TVP23CQ96ET8 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TVP23CQ96ET8 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TVP23CQ96ET8 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TVP23CQ96ET8 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TVP23CQ96ET8 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TVP23CQ96ET8 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TVP23CQ96ET8 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
TVP23CQ96ET8 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
TVP23CQ96ET8 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TVP23CQ96ET8 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
TVP23CQ96ET8 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TVP23CQ96ET8 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TVP23CQ96ET8 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TVP23CQ96ET8 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TVP23CQ96ET8 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
TVP23CQ96ET8 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.38
TVP23CQ96ET8 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.38
TVP23CQ96ET8 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TVP23CQ96ET8 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TVP23CQ96ET8 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TVP23CQ96ET8 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TVP23CQ96ET8 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TVP23CQ96ET8 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
TVP23CQ96ET8 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TVP23CQ96ET8 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TVP23CQ96ET8 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TVP23CQ96ET8 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TVP23CQ96ET8 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TVP23CQ96ET8 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TVP23CQ96ET8 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TVP23CQ96ET8 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TVP23CQ96ET8 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TVP23CQ96ET8 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TVP23CQ96ET8 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TVP23CQ96ET8 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TVP23CQ96ET8 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TVP23CQ96ET8 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TVP23CQ96ET8 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TVP23CQ96ET8 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TVP23CQ96ET8 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TVP23CQ96ET8 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TVP23CQ96ET8 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TVP23CQ96ET8 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TVP23CQ96ET8 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TVP23CQ96ET8 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TVP23CQ96ET8 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TVP23CQ96ET8 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TVP23CQ96ET8 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TVP23CQ96ET8 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms