Protein–RNA interactions for Protein: Q969G3

SMARCE1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily E member 1, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCE1Q969G3 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SMARCE1Q969G3 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SMARCE1Q969G3 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SMARCE1Q969G3 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SMARCE1Q969G3 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SMARCE1Q969G3 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SMARCE1Q969G3 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SMARCE1Q969G3 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SMARCE1Q969G3 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SMARCE1Q969G3 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SMARCE1Q969G3 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SMARCE1Q969G3 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SMARCE1Q969G3 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SMARCE1Q969G3 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SMARCE1Q969G3 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SMARCE1Q969G3 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SMARCE1Q969G3 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SMARCE1Q969G3 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SMARCE1Q969G3 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SMARCE1Q969G3 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SMARCE1Q969G3 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SMARCE1Q969G3 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SMARCE1Q969G3 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SMARCE1Q969G3 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SMARCE1Q969G3 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SMARCE1Q969G3 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SMARCE1Q969G3 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SMARCE1Q969G3 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SMARCE1Q969G3 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SMARCE1Q969G3 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SMARCE1Q969G3 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SMARCE1Q969G3 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SMARCE1Q969G3 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SMARCE1Q969G3 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SMARCE1Q969G3 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SMARCE1Q969G3 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SMARCE1Q969G3 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SMARCE1Q969G3 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SMARCE1Q969G3 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SMARCE1Q969G3 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SMARCE1Q969G3 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SMARCE1Q969G3 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SMARCE1Q969G3 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SMARCE1Q969G3 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SMARCE1Q969G3 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SMARCE1Q969G3 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SMARCE1Q969G3 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SMARCE1Q969G3 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SMARCE1Q969G3 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SMARCE1Q969G3 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SMARCE1Q969G3 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SMARCE1Q969G3 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SMARCE1Q969G3 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SMARCE1Q969G3 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SMARCE1Q969G3 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
SMARCE1Q969G3 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SMARCE1Q969G3 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SMARCE1Q969G3 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SMARCE1Q969G3 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SMARCE1Q969G3 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SMARCE1Q969G3 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SMARCE1Q969G3 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SMARCE1Q969G3 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SMARCE1Q969G3 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SMARCE1Q969G3 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SMARCE1Q969G3 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
SMARCE1Q969G3 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
SMARCE1Q969G3 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
SMARCE1Q969G3 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SMARCE1Q969G3 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SMARCE1Q969G3 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SMARCE1Q969G3 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SMARCE1Q969G3 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SMARCE1Q969G3 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SMARCE1Q969G3 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SMARCE1Q969G3 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SMARCE1Q969G3 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SMARCE1Q969G3 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SMARCE1Q969G3 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SMARCE1Q969G3 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SMARCE1Q969G3 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
SMARCE1Q969G3 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SMARCE1Q969G3 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SMARCE1Q969G3 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
SMARCE1Q969G3 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SMARCE1Q969G3 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SMARCE1Q969G3 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SMARCE1Q969G3 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SMARCE1Q969G3 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SMARCE1Q969G3 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SMARCE1Q969G3 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SMARCE1Q969G3 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SMARCE1Q969G3 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SMARCE1Q969G3 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SMARCE1Q969G3 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SMARCE1Q969G3 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SMARCE1Q969G3 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SMARCE1Q969G3 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SMARCE1Q969G3 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SMARCE1Q969G3 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.6 ms