Protein–RNA interactions for Protein: Q969E8

TSR2, Pre-rRNA-processing protein TSR2 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 191 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSR2Q969E8 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC28.82■■■□□ 2.2
TSR2Q969E8 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
TSR2Q969E8 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
TSR2Q969E8 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
TSR2Q969E8 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
TSR2Q969E8 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
TSR2Q969E8 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
TSR2Q969E8 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
TSR2Q969E8 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
TSR2Q969E8 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC28.81■■■□□ 2.2
TSR2Q969E8 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
TSR2Q969E8 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
TSR2Q969E8 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
TSR2Q969E8 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
TSR2Q969E8 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
TSR2Q969E8 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
TSR2Q969E8 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
TSR2Q969E8 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
TSR2Q969E8 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
TSR2Q969E8 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
TSR2Q969E8 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
TSR2Q969E8 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
TSR2Q969E8 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
TSR2Q969E8 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
TSR2Q969E8 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
TSR2Q969E8 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
TSR2Q969E8 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
TSR2Q969E8 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
TSR2Q969E8 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC28.78■■■□□ 2.2
TSR2Q969E8 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
TSR2Q969E8 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
TSR2Q969E8 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC28.78■■■□□ 2.2
TSR2Q969E8 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC28.78■■■□□ 2.2
TSR2Q969E8 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
TSR2Q969E8 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
TSR2Q969E8 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
TSR2Q969E8 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
TSR2Q969E8 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
TSR2Q969E8 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
TSR2Q969E8 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
TSR2Q969E8 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
TSR2Q969E8 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
TSR2Q969E8 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
TSR2Q969E8 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
TSR2Q969E8 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
TSR2Q969E8 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
TSR2Q969E8 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
TSR2Q969E8 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
TSR2Q969E8 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
TSR2Q969E8 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
TSR2Q969E8 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
TSR2Q969E8 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
TSR2Q969E8 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.76■■■□□ 2.19
TSR2Q969E8 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
TSR2Q969E8 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
TSR2Q969E8 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
TSR2Q969E8 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
TSR2Q969E8 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
TSR2Q969E8 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
TSR2Q969E8 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
TSR2Q969E8 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
TSR2Q969E8 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
TSR2Q969E8 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC28.74■■■□□ 2.19
TSR2Q969E8 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
TSR2Q969E8 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
TSR2Q969E8 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
TSR2Q969E8 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
TSR2Q969E8 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
TSR2Q969E8 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
TSR2Q969E8 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
TSR2Q969E8 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
TSR2Q969E8 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
TSR2Q969E8 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
TSR2Q969E8 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
TSR2Q969E8 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
TSR2Q969E8 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
TSR2Q969E8 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
TSR2Q969E8 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
TSR2Q969E8 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
TSR2Q969E8 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
TSR2Q969E8 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
TSR2Q969E8 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
TSR2Q969E8 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
TSR2Q969E8 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC28.72■■■□□ 2.19
TSR2Q969E8 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
TSR2Q969E8 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
TSR2Q969E8 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
TSR2Q969E8 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
TSR2Q969E8 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
TSR2Q969E8 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
TSR2Q969E8 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
TSR2Q969E8 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
TSR2Q969E8 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
TSR2Q969E8 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
TSR2Q969E8 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
TSR2Q969E8 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
TSR2Q969E8 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC28.71■■■□□ 2.19
TSR2Q969E8 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.71■■■□□ 2.19
TSR2Q969E8 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
TSR2Q969E8 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.9 ms