Protein–RNA interactions for Protein: Q93038

TNFRSF25, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 25, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFRSF25Q93038 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TNFRSF25Q93038 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.64
TNFRSF25Q93038 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TNFRSF25Q93038 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TNFRSF25Q93038 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
TNFRSF25Q93038 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TNFRSF25Q93038 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TNFRSF25Q93038 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
TNFRSF25Q93038 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TNFRSF25Q93038 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TNFRSF25Q93038 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TNFRSF25Q93038 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TNFRSF25Q93038 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TNFRSF25Q93038 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TNFRSF25Q93038 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TNFRSF25Q93038 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TNFRSF25Q93038 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TNFRSF25Q93038 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TNFRSF25Q93038 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TNFRSF25Q93038 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TNFRSF25Q93038 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TNFRSF25Q93038 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TNFRSF25Q93038 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TNFRSF25Q93038 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TNFRSF25Q93038 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TNFRSF25Q93038 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TNFRSF25Q93038 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TNFRSF25Q93038 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TNFRSF25Q93038 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TNFRSF25Q93038 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TNFRSF25Q93038 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TNFRSF25Q93038 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
TNFRSF25Q93038 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TNFRSF25Q93038 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
TNFRSF25Q93038 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
TNFRSF25Q93038 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TNFRSF25Q93038 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TNFRSF25Q93038 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TNFRSF25Q93038 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TNFRSF25Q93038 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TNFRSF25Q93038 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TNFRSF25Q93038 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TNFRSF25Q93038 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TNFRSF25Q93038 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TNFRSF25Q93038 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TNFRSF25Q93038 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TNFRSF25Q93038 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TNFRSF25Q93038 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TNFRSF25Q93038 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TNFRSF25Q93038 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TNFRSF25Q93038 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TNFRSF25Q93038 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TNFRSF25Q93038 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TNFRSF25Q93038 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TNFRSF25Q93038 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TNFRSF25Q93038 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TNFRSF25Q93038 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TNFRSF25Q93038 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TNFRSF25Q93038 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TNFRSF25Q93038 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TNFRSF25Q93038 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TNFRSF25Q93038 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TNFRSF25Q93038 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TNFRSF25Q93038 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TNFRSF25Q93038 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TNFRSF25Q93038 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
TNFRSF25Q93038 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TNFRSF25Q93038 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TNFRSF25Q93038 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
TNFRSF25Q93038 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TNFRSF25Q93038 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TNFRSF25Q93038 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TNFRSF25Q93038 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TNFRSF25Q93038 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TNFRSF25Q93038 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TNFRSF25Q93038 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TNFRSF25Q93038 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TNFRSF25Q93038 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TNFRSF25Q93038 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TNFRSF25Q93038 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TNFRSF25Q93038 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TNFRSF25Q93038 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TNFRSF25Q93038 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TNFRSF25Q93038 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TNFRSF25Q93038 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TNFRSF25Q93038 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TNFRSF25Q93038 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TNFRSF25Q93038 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
TNFRSF25Q93038 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TNFRSF25Q93038 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TNFRSF25Q93038 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TNFRSF25Q93038 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TNFRSF25Q93038 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TNFRSF25Q93038 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TNFRSF25Q93038 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TNFRSF25Q93038 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TNFRSF25Q93038 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TNFRSF25Q93038 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TNFRSF25Q93038 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TNFRSF25Q93038 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.6 ms