Protein–RNA interactions for Protein: Q92837

FRAT1, Proto-oncogene FRAT1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FRAT1Q92837 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
FRAT1Q92837 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
FRAT1Q92837 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
FRAT1Q92837 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
FRAT1Q92837 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
FRAT1Q92837 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
FRAT1Q92837 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
FRAT1Q92837 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
FRAT1Q92837 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
FRAT1Q92837 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
FRAT1Q92837 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
FRAT1Q92837 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
FRAT1Q92837 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
FRAT1Q92837 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
FRAT1Q92837 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
FRAT1Q92837 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
FRAT1Q92837 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
FRAT1Q92837 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
FRAT1Q92837 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
FRAT1Q92837 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
FRAT1Q92837 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC28.46■■■□□ 2.15
FRAT1Q92837 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC28.46■■■□□ 2.15
FRAT1Q92837 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
FRAT1Q92837 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
FRAT1Q92837 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
FRAT1Q92837 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
FRAT1Q92837 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
FRAT1Q92837 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
FRAT1Q92837 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.15
FRAT1Q92837 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
FRAT1Q92837 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.15
FRAT1Q92837 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
FRAT1Q92837 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.15
FRAT1Q92837 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
FRAT1Q92837 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
FRAT1Q92837 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
FRAT1Q92837 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
FRAT1Q92837 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
FRAT1Q92837 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
FRAT1Q92837 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
FRAT1Q92837 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
FRAT1Q92837 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
FRAT1Q92837 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
FRAT1Q92837 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
FRAT1Q92837 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
FRAT1Q92837 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
FRAT1Q92837 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC28.44■■■□□ 2.14
FRAT1Q92837 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
FRAT1Q92837 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
FRAT1Q92837 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
FRAT1Q92837 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
FRAT1Q92837 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
FRAT1Q92837 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
FRAT1Q92837 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
FRAT1Q92837 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
FRAT1Q92837 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
FRAT1Q92837 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
FRAT1Q92837 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
FRAT1Q92837 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
FRAT1Q92837 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
FRAT1Q92837 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC28.43■■■□□ 2.14
FRAT1Q92837 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
FRAT1Q92837 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
FRAT1Q92837 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
FRAT1Q92837 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC28.42■■■□□ 2.14
FRAT1Q92837 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
FRAT1Q92837 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
FRAT1Q92837 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
FRAT1Q92837 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
FRAT1Q92837 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
FRAT1Q92837 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC28.41■■■□□ 2.14
FRAT1Q92837 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
FRAT1Q92837 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
FRAT1Q92837 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
FRAT1Q92837 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
FRAT1Q92837 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
FRAT1Q92837 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
FRAT1Q92837 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
FRAT1Q92837 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
FRAT1Q92837 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
FRAT1Q92837 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
FRAT1Q92837 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
FRAT1Q92837 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
FRAT1Q92837 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
FRAT1Q92837 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
FRAT1Q92837 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
FRAT1Q92837 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
FRAT1Q92837 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
FRAT1Q92837 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
FRAT1Q92837 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
FRAT1Q92837 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
FRAT1Q92837 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
FRAT1Q92837 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
FRAT1Q92837 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.13
FRAT1Q92837 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
FRAT1Q92837 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
FRAT1Q92837 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
FRAT1Q92837 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
FRAT1Q92837 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
FRAT1Q92837 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.7 ms