Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXF1

PSPC1, Paraspeckle component 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 523 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSPC1Q8WXF1 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PSPC1Q8WXF1 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PSPC1Q8WXF1 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PSPC1Q8WXF1 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PSPC1Q8WXF1 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PSPC1Q8WXF1 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PSPC1Q8WXF1 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PSPC1Q8WXF1 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PSPC1Q8WXF1 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PSPC1Q8WXF1 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PSPC1Q8WXF1 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PSPC1Q8WXF1 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PSPC1Q8WXF1 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PSPC1Q8WXF1 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PSPC1Q8WXF1 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PSPC1Q8WXF1 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PSPC1Q8WXF1 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PSPC1Q8WXF1 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PSPC1Q8WXF1 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
PSPC1Q8WXF1 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PSPC1Q8WXF1 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PSPC1Q8WXF1 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PSPC1Q8WXF1 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PSPC1Q8WXF1 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PSPC1Q8WXF1 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PSPC1Q8WXF1 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PSPC1Q8WXF1 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PSPC1Q8WXF1 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PSPC1Q8WXF1 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
PSPC1Q8WXF1 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PSPC1Q8WXF1 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PSPC1Q8WXF1 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PSPC1Q8WXF1 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PSPC1Q8WXF1 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PSPC1Q8WXF1 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PSPC1Q8WXF1 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PSPC1Q8WXF1 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PSPC1Q8WXF1 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PSPC1Q8WXF1 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PSPC1Q8WXF1 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PSPC1Q8WXF1 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PSPC1Q8WXF1 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PSPC1Q8WXF1 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PSPC1Q8WXF1 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PSPC1Q8WXF1 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PSPC1Q8WXF1 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PSPC1Q8WXF1 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PSPC1Q8WXF1 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PSPC1Q8WXF1 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PSPC1Q8WXF1 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PSPC1Q8WXF1 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PSPC1Q8WXF1 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PSPC1Q8WXF1 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PSPC1Q8WXF1 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PSPC1Q8WXF1 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PSPC1Q8WXF1 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PSPC1Q8WXF1 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PSPC1Q8WXF1 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.51
PSPC1Q8WXF1 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
PSPC1Q8WXF1 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
PSPC1Q8WXF1 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PSPC1Q8WXF1 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PSPC1Q8WXF1 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PSPC1Q8WXF1 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PSPC1Q8WXF1 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PSPC1Q8WXF1 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PSPC1Q8WXF1 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
PSPC1Q8WXF1 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PSPC1Q8WXF1 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PSPC1Q8WXF1 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PSPC1Q8WXF1 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PSPC1Q8WXF1 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PSPC1Q8WXF1 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
PSPC1Q8WXF1 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PSPC1Q8WXF1 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PSPC1Q8WXF1 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
PSPC1Q8WXF1 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PSPC1Q8WXF1 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PSPC1Q8WXF1 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PSPC1Q8WXF1 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PSPC1Q8WXF1 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PSPC1Q8WXF1 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PSPC1Q8WXF1 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PSPC1Q8WXF1 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PSPC1Q8WXF1 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
PSPC1Q8WXF1 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PSPC1Q8WXF1 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PSPC1Q8WXF1 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PSPC1Q8WXF1 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PSPC1Q8WXF1 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PSPC1Q8WXF1 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
PSPC1Q8WXF1 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PSPC1Q8WXF1 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PSPC1Q8WXF1 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PSPC1Q8WXF1 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PSPC1Q8WXF1 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PSPC1Q8WXF1 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PSPC1Q8WXF1 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PSPC1Q8WXF1 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PSPC1Q8WXF1 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
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