Protein–RNA interactions for Protein: Q8WUY3

PRUNE2, Protein prune homolog 2, humanhuman

Predictions only

Length 3,088 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRUNE2Q8WUY3 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PRUNE2Q8WUY3 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PRUNE2Q8WUY3 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PRUNE2Q8WUY3 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PRUNE2Q8WUY3 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PRUNE2Q8WUY3 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PRUNE2Q8WUY3 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PRUNE2Q8WUY3 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PRUNE2Q8WUY3 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PRUNE2Q8WUY3 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PRUNE2Q8WUY3 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PRUNE2Q8WUY3 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PRUNE2Q8WUY3 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PRUNE2Q8WUY3 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PRUNE2Q8WUY3 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
PRUNE2Q8WUY3 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PRUNE2Q8WUY3 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PRUNE2Q8WUY3 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PRUNE2Q8WUY3 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PRUNE2Q8WUY3 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PRUNE2Q8WUY3 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PRUNE2Q8WUY3 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PRUNE2Q8WUY3 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PRUNE2Q8WUY3 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PRUNE2Q8WUY3 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PRUNE2Q8WUY3 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PRUNE2Q8WUY3 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PRUNE2Q8WUY3 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PRUNE2Q8WUY3 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PRUNE2Q8WUY3 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PRUNE2Q8WUY3 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PRUNE2Q8WUY3 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PRUNE2Q8WUY3 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PRUNE2Q8WUY3 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PRUNE2Q8WUY3 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PRUNE2Q8WUY3 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PRUNE2Q8WUY3 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PRUNE2Q8WUY3 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PRUNE2Q8WUY3 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PRUNE2Q8WUY3 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PRUNE2Q8WUY3 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PRUNE2Q8WUY3 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PRUNE2Q8WUY3 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PRUNE2Q8WUY3 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PRUNE2Q8WUY3 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PRUNE2Q8WUY3 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PRUNE2Q8WUY3 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PRUNE2Q8WUY3 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PRUNE2Q8WUY3 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PRUNE2Q8WUY3 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PRUNE2Q8WUY3 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PRUNE2Q8WUY3 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PRUNE2Q8WUY3 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
PRUNE2Q8WUY3 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PRUNE2Q8WUY3 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PRUNE2Q8WUY3 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PRUNE2Q8WUY3 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
PRUNE2Q8WUY3 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PRUNE2Q8WUY3 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PRUNE2Q8WUY3 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PRUNE2Q8WUY3 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
PRUNE2Q8WUY3 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PRUNE2Q8WUY3 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PRUNE2Q8WUY3 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PRUNE2Q8WUY3 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
PRUNE2Q8WUY3 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PRUNE2Q8WUY3 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PRUNE2Q8WUY3 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
PRUNE2Q8WUY3 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PRUNE2Q8WUY3 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
PRUNE2Q8WUY3 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PRUNE2Q8WUY3 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
PRUNE2Q8WUY3 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PRUNE2Q8WUY3 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PRUNE2Q8WUY3 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PRUNE2Q8WUY3 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
PRUNE2Q8WUY3 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
PRUNE2Q8WUY3 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PRUNE2Q8WUY3 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PRUNE2Q8WUY3 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PRUNE2Q8WUY3 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PRUNE2Q8WUY3 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PRUNE2Q8WUY3 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PRUNE2Q8WUY3 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PRUNE2Q8WUY3 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PRUNE2Q8WUY3 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
PRUNE2Q8WUY3 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
PRUNE2Q8WUY3 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PRUNE2Q8WUY3 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PRUNE2Q8WUY3 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PRUNE2Q8WUY3 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PRUNE2Q8WUY3 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PRUNE2Q8WUY3 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
PRUNE2Q8WUY3 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PRUNE2Q8WUY3 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PRUNE2Q8WUY3 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PRUNE2Q8WUY3 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PRUNE2Q8WUY3 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PRUNE2Q8WUY3 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
PRUNE2Q8WUY3 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms