Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDF6

RASGRP4, RAS guanyl-releasing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 673 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RASGRP4Q8TDF6 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RASGRP4Q8TDF6 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
RASGRP4Q8TDF6 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
RASGRP4Q8TDF6 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
RASGRP4Q8TDF6 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
RASGRP4Q8TDF6 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
RASGRP4Q8TDF6 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
RASGRP4Q8TDF6 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
RASGRP4Q8TDF6 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
RASGRP4Q8TDF6 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
RASGRP4Q8TDF6 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
RASGRP4Q8TDF6 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
RASGRP4Q8TDF6 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
RASGRP4Q8TDF6 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
RASGRP4Q8TDF6 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
RASGRP4Q8TDF6 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
RASGRP4Q8TDF6 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
RASGRP4Q8TDF6 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
RASGRP4Q8TDF6 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
RASGRP4Q8TDF6 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
RASGRP4Q8TDF6 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
RASGRP4Q8TDF6 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
RASGRP4Q8TDF6 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
RASGRP4Q8TDF6 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
RASGRP4Q8TDF6 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
RASGRP4Q8TDF6 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RASGRP4Q8TDF6 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
RASGRP4Q8TDF6 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RASGRP4Q8TDF6 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RASGRP4Q8TDF6 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
RASGRP4Q8TDF6 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
RASGRP4Q8TDF6 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
RASGRP4Q8TDF6 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
RASGRP4Q8TDF6 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
RASGRP4Q8TDF6 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
RASGRP4Q8TDF6 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
RASGRP4Q8TDF6 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
RASGRP4Q8TDF6 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
RASGRP4Q8TDF6 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
RASGRP4Q8TDF6 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
RASGRP4Q8TDF6 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
RASGRP4Q8TDF6 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
RASGRP4Q8TDF6 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
RASGRP4Q8TDF6 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
RASGRP4Q8TDF6 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
RASGRP4Q8TDF6 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
RASGRP4Q8TDF6 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
RASGRP4Q8TDF6 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
RASGRP4Q8TDF6 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RASGRP4Q8TDF6 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RASGRP4Q8TDF6 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RASGRP4Q8TDF6 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
RASGRP4Q8TDF6 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
RASGRP4Q8TDF6 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
RASGRP4Q8TDF6 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
RASGRP4Q8TDF6 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RASGRP4Q8TDF6 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RASGRP4Q8TDF6 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
RASGRP4Q8TDF6 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
RASGRP4Q8TDF6 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
RASGRP4Q8TDF6 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
RASGRP4Q8TDF6 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC25.34■■□□□ 1.65
RASGRP4Q8TDF6 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
RASGRP4Q8TDF6 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
RASGRP4Q8TDF6 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
RASGRP4Q8TDF6 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RASGRP4Q8TDF6 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
RASGRP4Q8TDF6 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
RASGRP4Q8TDF6 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
RASGRP4Q8TDF6 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
RASGRP4Q8TDF6 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
RASGRP4Q8TDF6 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
RASGRP4Q8TDF6 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
RASGRP4Q8TDF6 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
RASGRP4Q8TDF6 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
RASGRP4Q8TDF6 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
RASGRP4Q8TDF6 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
RASGRP4Q8TDF6 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
RASGRP4Q8TDF6 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
RASGRP4Q8TDF6 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.64
RASGRP4Q8TDF6 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
RASGRP4Q8TDF6 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RASGRP4Q8TDF6 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RASGRP4Q8TDF6 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RASGRP4Q8TDF6 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RASGRP4Q8TDF6 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.32■■□□□ 1.64
RASGRP4Q8TDF6 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
RASGRP4Q8TDF6 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
RASGRP4Q8TDF6 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
RASGRP4Q8TDF6 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RASGRP4Q8TDF6 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RASGRP4Q8TDF6 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RASGRP4Q8TDF6 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RASGRP4Q8TDF6 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
RASGRP4Q8TDF6 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RASGRP4Q8TDF6 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RASGRP4Q8TDF6 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
RASGRP4Q8TDF6 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
RASGRP4Q8TDF6 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
RASGRP4Q8TDF6 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74 ms