Protein–RNA interactions for Protein: Q8TD19

NEK9, Serine/threonine-protein kinase Nek9, humanhuman

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Length 979 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEK9Q8TD19 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
NEK9Q8TD19 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
NEK9Q8TD19 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
NEK9Q8TD19 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
NEK9Q8TD19 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
NEK9Q8TD19 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NEK9Q8TD19 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NEK9Q8TD19 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
NEK9Q8TD19 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
NEK9Q8TD19 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
NEK9Q8TD19 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
NEK9Q8TD19 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
NEK9Q8TD19 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
NEK9Q8TD19 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
NEK9Q8TD19 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
NEK9Q8TD19 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
NEK9Q8TD19 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
NEK9Q8TD19 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
NEK9Q8TD19 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
NEK9Q8TD19 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
NEK9Q8TD19 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
NEK9Q8TD19 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
NEK9Q8TD19 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
NEK9Q8TD19 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
NEK9Q8TD19 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
NEK9Q8TD19 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
NEK9Q8TD19 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
NEK9Q8TD19 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
NEK9Q8TD19 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
NEK9Q8TD19 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
NEK9Q8TD19 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
NEK9Q8TD19 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
NEK9Q8TD19 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
NEK9Q8TD19 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
NEK9Q8TD19 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
NEK9Q8TD19 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
NEK9Q8TD19 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
NEK9Q8TD19 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
NEK9Q8TD19 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
NEK9Q8TD19 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
NEK9Q8TD19 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
NEK9Q8TD19 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
NEK9Q8TD19 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
NEK9Q8TD19 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
NEK9Q8TD19 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
NEK9Q8TD19 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
NEK9Q8TD19 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
NEK9Q8TD19 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
NEK9Q8TD19 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.56
NEK9Q8TD19 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
NEK9Q8TD19 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
NEK9Q8TD19 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
NEK9Q8TD19 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
NEK9Q8TD19 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
NEK9Q8TD19 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
NEK9Q8TD19 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
NEK9Q8TD19 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
NEK9Q8TD19 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
NEK9Q8TD19 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
NEK9Q8TD19 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
NEK9Q8TD19 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NEK9Q8TD19 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NEK9Q8TD19 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NEK9Q8TD19 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
NEK9Q8TD19 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
NEK9Q8TD19 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
NEK9Q8TD19 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
NEK9Q8TD19 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
NEK9Q8TD19 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
NEK9Q8TD19 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
NEK9Q8TD19 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NEK9Q8TD19 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
NEK9Q8TD19 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
NEK9Q8TD19 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
NEK9Q8TD19 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
NEK9Q8TD19 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
NEK9Q8TD19 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
NEK9Q8TD19 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
NEK9Q8TD19 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
NEK9Q8TD19 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
NEK9Q8TD19 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
NEK9Q8TD19 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
NEK9Q8TD19 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
NEK9Q8TD19 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
NEK9Q8TD19 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NEK9Q8TD19 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NEK9Q8TD19 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
NEK9Q8TD19 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
NEK9Q8TD19 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
NEK9Q8TD19 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NEK9Q8TD19 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NEK9Q8TD19 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
NEK9Q8TD19 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NEK9Q8TD19 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NEK9Q8TD19 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NEK9Q8TD19 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NEK9Q8TD19 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
NEK9Q8TD19 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
NEK9Q8TD19 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NEK9Q8TD19 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
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