Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6L0

CCDC155, Protein KASH5, humanhuman

Predictions only

Length 562 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC155Q8N6L0 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CCDC155Q8N6L0 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CCDC155Q8N6L0 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CCDC155Q8N6L0 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CCDC155Q8N6L0 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CCDC155Q8N6L0 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CCDC155Q8N6L0 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
CCDC155Q8N6L0 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
CCDC155Q8N6L0 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CCDC155Q8N6L0 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
CCDC155Q8N6L0 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CCDC155Q8N6L0 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CCDC155Q8N6L0 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
CCDC155Q8N6L0 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
CCDC155Q8N6L0 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CCDC155Q8N6L0 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CCDC155Q8N6L0 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCDC155Q8N6L0 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCDC155Q8N6L0 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCDC155Q8N6L0 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCDC155Q8N6L0 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCDC155Q8N6L0 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCDC155Q8N6L0 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCDC155Q8N6L0 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCDC155Q8N6L0 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCDC155Q8N6L0 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCDC155Q8N6L0 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCDC155Q8N6L0 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCDC155Q8N6L0 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCDC155Q8N6L0 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCDC155Q8N6L0 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCDC155Q8N6L0 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCDC155Q8N6L0 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCDC155Q8N6L0 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC155Q8N6L0 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC155Q8N6L0 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC155Q8N6L0 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC155Q8N6L0 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC155Q8N6L0 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC155Q8N6L0 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC155Q8N6L0 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC155Q8N6L0 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC155Q8N6L0 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC155Q8N6L0 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC155Q8N6L0 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC155Q8N6L0 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC155Q8N6L0 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC155Q8N6L0 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CCDC155Q8N6L0 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CCDC155Q8N6L0 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CCDC155Q8N6L0 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CCDC155Q8N6L0 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CCDC155Q8N6L0 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CCDC155Q8N6L0 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CCDC155Q8N6L0 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CCDC155Q8N6L0 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
CCDC155Q8N6L0 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CCDC155Q8N6L0 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CCDC155Q8N6L0 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CCDC155Q8N6L0 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CCDC155Q8N6L0 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CCDC155Q8N6L0 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCDC155Q8N6L0 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCDC155Q8N6L0 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCDC155Q8N6L0 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCDC155Q8N6L0 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCDC155Q8N6L0 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCDC155Q8N6L0 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCDC155Q8N6L0 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCDC155Q8N6L0 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCDC155Q8N6L0 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCDC155Q8N6L0 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC155Q8N6L0 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC155Q8N6L0 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC155Q8N6L0 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC155Q8N6L0 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC155Q8N6L0 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC155Q8N6L0 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC155Q8N6L0 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC155Q8N6L0 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC155Q8N6L0 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC155Q8N6L0 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC155Q8N6L0 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC155Q8N6L0 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCDC155Q8N6L0 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCDC155Q8N6L0 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCDC155Q8N6L0 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCDC155Q8N6L0 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCDC155Q8N6L0 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCDC155Q8N6L0 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCDC155Q8N6L0 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
CCDC155Q8N6L0 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCDC155Q8N6L0 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCDC155Q8N6L0 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCDC155Q8N6L0 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCDC155Q8N6L0 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCDC155Q8N6L0 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCDC155Q8N6L0 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCDC155Q8N6L0 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCDC155Q8N6L0 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms