Protein–RNA interactions for Protein: Q8N5Q1

FAM71E2, Protein FAM71E2, humanhuman

Predictions only

Length 922 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM71E2Q8N5Q1 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
FAM71E2Q8N5Q1 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
FAM71E2Q8N5Q1 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
FAM71E2Q8N5Q1 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
FAM71E2Q8N5Q1 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
FAM71E2Q8N5Q1 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
FAM71E2Q8N5Q1 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
FAM71E2Q8N5Q1 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
FAM71E2Q8N5Q1 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
FAM71E2Q8N5Q1 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
FAM71E2Q8N5Q1 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
FAM71E2Q8N5Q1 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
FAM71E2Q8N5Q1 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
FAM71E2Q8N5Q1 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
FAM71E2Q8N5Q1 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
FAM71E2Q8N5Q1 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
FAM71E2Q8N5Q1 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
FAM71E2Q8N5Q1 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
FAM71E2Q8N5Q1 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
FAM71E2Q8N5Q1 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
FAM71E2Q8N5Q1 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
FAM71E2Q8N5Q1 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
FAM71E2Q8N5Q1 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
FAM71E2Q8N5Q1 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
FAM71E2Q8N5Q1 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
FAM71E2Q8N5Q1 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
FAM71E2Q8N5Q1 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
FAM71E2Q8N5Q1 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
FAM71E2Q8N5Q1 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
FAM71E2Q8N5Q1 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
FAM71E2Q8N5Q1 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
FAM71E2Q8N5Q1 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
FAM71E2Q8N5Q1 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
FAM71E2Q8N5Q1 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
FAM71E2Q8N5Q1 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
FAM71E2Q8N5Q1 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
FAM71E2Q8N5Q1 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
FAM71E2Q8N5Q1 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
FAM71E2Q8N5Q1 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
FAM71E2Q8N5Q1 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
FAM71E2Q8N5Q1 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
FAM71E2Q8N5Q1 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
FAM71E2Q8N5Q1 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
FAM71E2Q8N5Q1 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
FAM71E2Q8N5Q1 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
FAM71E2Q8N5Q1 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
FAM71E2Q8N5Q1 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
FAM71E2Q8N5Q1 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
FAM71E2Q8N5Q1 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
FAM71E2Q8N5Q1 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC18.48■□□□□ 0.55
FAM71E2Q8N5Q1 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
FAM71E2Q8N5Q1 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
FAM71E2Q8N5Q1 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
FAM71E2Q8N5Q1 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
FAM71E2Q8N5Q1 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
FAM71E2Q8N5Q1 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
FAM71E2Q8N5Q1 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
FAM71E2Q8N5Q1 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
FAM71E2Q8N5Q1 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
FAM71E2Q8N5Q1 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
FAM71E2Q8N5Q1 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
FAM71E2Q8N5Q1 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
FAM71E2Q8N5Q1 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
FAM71E2Q8N5Q1 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
FAM71E2Q8N5Q1 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
FAM71E2Q8N5Q1 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
FAM71E2Q8N5Q1 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
FAM71E2Q8N5Q1 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
FAM71E2Q8N5Q1 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
FAM71E2Q8N5Q1 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
FAM71E2Q8N5Q1 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
FAM71E2Q8N5Q1 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
FAM71E2Q8N5Q1 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
FAM71E2Q8N5Q1 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
FAM71E2Q8N5Q1 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
FAM71E2Q8N5Q1 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
FAM71E2Q8N5Q1 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
FAM71E2Q8N5Q1 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
FAM71E2Q8N5Q1 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
FAM71E2Q8N5Q1 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
FAM71E2Q8N5Q1 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
FAM71E2Q8N5Q1 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
FAM71E2Q8N5Q1 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
FAM71E2Q8N5Q1 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
FAM71E2Q8N5Q1 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
FAM71E2Q8N5Q1 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
FAM71E2Q8N5Q1 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
FAM71E2Q8N5Q1 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
FAM71E2Q8N5Q1 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
FAM71E2Q8N5Q1 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
FAM71E2Q8N5Q1 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
FAM71E2Q8N5Q1 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
FAM71E2Q8N5Q1 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
FAM71E2Q8N5Q1 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
FAM71E2Q8N5Q1 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
FAM71E2Q8N5Q1 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
FAM71E2Q8N5Q1 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
FAM71E2Q8N5Q1 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
FAM71E2Q8N5Q1 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
FAM71E2Q8N5Q1 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16 ms