Protein–RNA interactions for Protein: Q86X95

CIR1, Corepressor interacting with RBPJ 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CIR1Q86X95 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CIR1Q86X95 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CIR1Q86X95 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CIR1Q86X95 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CIR1Q86X95 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CIR1Q86X95 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CIR1Q86X95 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CIR1Q86X95 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CIR1Q86X95 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CIR1Q86X95 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CIR1Q86X95 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CIR1Q86X95 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CIR1Q86X95 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CIR1Q86X95 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CIR1Q86X95 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CIR1Q86X95 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CIR1Q86X95 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CIR1Q86X95 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CIR1Q86X95 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CIR1Q86X95 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CIR1Q86X95 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CIR1Q86X95 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CIR1Q86X95 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CIR1Q86X95 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CIR1Q86X95 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CIR1Q86X95 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CIR1Q86X95 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CIR1Q86X95 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CIR1Q86X95 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CIR1Q86X95 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CIR1Q86X95 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CIR1Q86X95 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CIR1Q86X95 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
CIR1Q86X95 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CIR1Q86X95 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
CIR1Q86X95 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CIR1Q86X95 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CIR1Q86X95 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CIR1Q86X95 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CIR1Q86X95 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CIR1Q86X95 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CIR1Q86X95 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CIR1Q86X95 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CIR1Q86X95 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CIR1Q86X95 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CIR1Q86X95 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CIR1Q86X95 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
CIR1Q86X95 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CIR1Q86X95 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CIR1Q86X95 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CIR1Q86X95 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CIR1Q86X95 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CIR1Q86X95 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CIR1Q86X95 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
CIR1Q86X95 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CIR1Q86X95 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CIR1Q86X95 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CIR1Q86X95 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CIR1Q86X95 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CIR1Q86X95 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CIR1Q86X95 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CIR1Q86X95 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CIR1Q86X95 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CIR1Q86X95 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CIR1Q86X95 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CIR1Q86X95 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CIR1Q86X95 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CIR1Q86X95 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CIR1Q86X95 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CIR1Q86X95 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CIR1Q86X95 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
CIR1Q86X95 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CIR1Q86X95 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CIR1Q86X95 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CIR1Q86X95 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CIR1Q86X95 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CIR1Q86X95 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CIR1Q86X95 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CIR1Q86X95 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CIR1Q86X95 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CIR1Q86X95 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CIR1Q86X95 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CIR1Q86X95 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CIR1Q86X95 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CIR1Q86X95 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CIR1Q86X95 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CIR1Q86X95 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CIR1Q86X95 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CIR1Q86X95 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CIR1Q86X95 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CIR1Q86X95 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CIR1Q86X95 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CIR1Q86X95 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CIR1Q86X95 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CIR1Q86X95 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CIR1Q86X95 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CIR1Q86X95 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CIR1Q86X95 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CIR1Q86X95 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CIR1Q86X95 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.9 ms