Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z7G1

CLNK, Cytokine-dependent hematopoietic cell linker, humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLNKQ7Z7G1 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CLNKQ7Z7G1 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CLNKQ7Z7G1 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CLNKQ7Z7G1 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CLNKQ7Z7G1 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CLNKQ7Z7G1 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CLNKQ7Z7G1 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CLNKQ7Z7G1 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CLNKQ7Z7G1 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CLNKQ7Z7G1 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CLNKQ7Z7G1 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CLNKQ7Z7G1 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CLNKQ7Z7G1 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CLNKQ7Z7G1 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CLNKQ7Z7G1 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CLNKQ7Z7G1 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CLNKQ7Z7G1 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CLNKQ7Z7G1 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CLNKQ7Z7G1 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CLNKQ7Z7G1 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CLNKQ7Z7G1 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CLNKQ7Z7G1 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CLNKQ7Z7G1 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CLNKQ7Z7G1 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CLNKQ7Z7G1 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CLNKQ7Z7G1 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CLNKQ7Z7G1 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CLNKQ7Z7G1 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CLNKQ7Z7G1 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CLNKQ7Z7G1 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CLNKQ7Z7G1 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CLNKQ7Z7G1 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CLNKQ7Z7G1 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
CLNKQ7Z7G1 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CLNKQ7Z7G1 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CLNKQ7Z7G1 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CLNKQ7Z7G1 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CLNKQ7Z7G1 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CLNKQ7Z7G1 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CLNKQ7Z7G1 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.1
CLNKQ7Z7G1 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
CLNKQ7Z7G1 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CLNKQ7Z7G1 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
CLNKQ7Z7G1 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CLNKQ7Z7G1 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
CLNKQ7Z7G1 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CLNKQ7Z7G1 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CLNKQ7Z7G1 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CLNKQ7Z7G1 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CLNKQ7Z7G1 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CLNKQ7Z7G1 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CLNKQ7Z7G1 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CLNKQ7Z7G1 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CLNKQ7Z7G1 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CLNKQ7Z7G1 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CLNKQ7Z7G1 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CLNKQ7Z7G1 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CLNKQ7Z7G1 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CLNKQ7Z7G1 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CLNKQ7Z7G1 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CLNKQ7Z7G1 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CLNKQ7Z7G1 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CLNKQ7Z7G1 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CLNKQ7Z7G1 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CLNKQ7Z7G1 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CLNKQ7Z7G1 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CLNKQ7Z7G1 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CLNKQ7Z7G1 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CLNKQ7Z7G1 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CLNKQ7Z7G1 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CLNKQ7Z7G1 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CLNKQ7Z7G1 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CLNKQ7Z7G1 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CLNKQ7Z7G1 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CLNKQ7Z7G1 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CLNKQ7Z7G1 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CLNKQ7Z7G1 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CLNKQ7Z7G1 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CLNKQ7Z7G1 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CLNKQ7Z7G1 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CLNKQ7Z7G1 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CLNKQ7Z7G1 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CLNKQ7Z7G1 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CLNKQ7Z7G1 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
CLNKQ7Z7G1 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CLNKQ7Z7G1 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CLNKQ7Z7G1 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CLNKQ7Z7G1 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CLNKQ7Z7G1 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CLNKQ7Z7G1 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CLNKQ7Z7G1 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CLNKQ7Z7G1 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CLNKQ7Z7G1 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CLNKQ7Z7G1 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CLNKQ7Z7G1 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CLNKQ7Z7G1 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CLNKQ7Z7G1 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CLNKQ7Z7G1 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CLNKQ7Z7G1 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CLNKQ7Z7G1 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms