Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z614

SNX20, Sorting nexin-20, humanhuman

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX20Q7Z614 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SNX20Q7Z614 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SNX20Q7Z614 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SNX20Q7Z614 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
SNX20Q7Z614 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SNX20Q7Z614 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
SNX20Q7Z614 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
SNX20Q7Z614 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
SNX20Q7Z614 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22.02■■□□□ 1.11
SNX20Q7Z614 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
SNX20Q7Z614 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SNX20Q7Z614 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SNX20Q7Z614 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SNX20Q7Z614 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SNX20Q7Z614 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SNX20Q7Z614 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SNX20Q7Z614 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
SNX20Q7Z614 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SNX20Q7Z614 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SNX20Q7Z614 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SNX20Q7Z614 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SNX20Q7Z614 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SNX20Q7Z614 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SNX20Q7Z614 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SNX20Q7Z614 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
SNX20Q7Z614 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SNX20Q7Z614 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SNX20Q7Z614 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SNX20Q7Z614 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SNX20Q7Z614 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SNX20Q7Z614 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SNX20Q7Z614 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SNX20Q7Z614 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SNX20Q7Z614 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SNX20Q7Z614 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SNX20Q7Z614 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SNX20Q7Z614 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SNX20Q7Z614 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
SNX20Q7Z614 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SNX20Q7Z614 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SNX20Q7Z614 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
SNX20Q7Z614 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
SNX20Q7Z614 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SNX20Q7Z614 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SNX20Q7Z614 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
SNX20Q7Z614 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SNX20Q7Z614 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SNX20Q7Z614 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SNX20Q7Z614 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SNX20Q7Z614 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
SNX20Q7Z614 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SNX20Q7Z614 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SNX20Q7Z614 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SNX20Q7Z614 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SNX20Q7Z614 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SNX20Q7Z614 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SNX20Q7Z614 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SNX20Q7Z614 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SNX20Q7Z614 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SNX20Q7Z614 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SNX20Q7Z614 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SNX20Q7Z614 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SNX20Q7Z614 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SNX20Q7Z614 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SNX20Q7Z614 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SNX20Q7Z614 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SNX20Q7Z614 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SNX20Q7Z614 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SNX20Q7Z614 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SNX20Q7Z614 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SNX20Q7Z614 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SNX20Q7Z614 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SNX20Q7Z614 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SNX20Q7Z614 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SNX20Q7Z614 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SNX20Q7Z614 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SNX20Q7Z614 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SNX20Q7Z614 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SNX20Q7Z614 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SNX20Q7Z614 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SNX20Q7Z614 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
SNX20Q7Z614 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
SNX20Q7Z614 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SNX20Q7Z614 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SNX20Q7Z614 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SNX20Q7Z614 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SNX20Q7Z614 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SNX20Q7Z614 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SNX20Q7Z614 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SNX20Q7Z614 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SNX20Q7Z614 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SNX20Q7Z614 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SNX20Q7Z614 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SNX20Q7Z614 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SNX20Q7Z614 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SNX20Q7Z614 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SNX20Q7Z614 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SNX20Q7Z614 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SNX20Q7Z614 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SNX20Q7Z614 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.4 ms