Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZNI0

GCNT7, Beta-1,3-galactosyl-O-glycosyl-glycoprotein beta-1,6-N-acetylglucosaminyltransferase 7, humanhuman

Predictions only

Length 430 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCNT7Q6ZNI0 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
GCNT7Q6ZNI0 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GCNT7Q6ZNI0 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GCNT7Q6ZNI0 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GCNT7Q6ZNI0 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
GCNT7Q6ZNI0 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
GCNT7Q6ZNI0 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
GCNT7Q6ZNI0 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
GCNT7Q6ZNI0 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
GCNT7Q6ZNI0 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.14
GCNT7Q6ZNI0 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GCNT7Q6ZNI0 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GCNT7Q6ZNI0 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GCNT7Q6ZNI0 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GCNT7Q6ZNI0 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GCNT7Q6ZNI0 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GCNT7Q6ZNI0 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GCNT7Q6ZNI0 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GCNT7Q6ZNI0 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GCNT7Q6ZNI0 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GCNT7Q6ZNI0 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GCNT7Q6ZNI0 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GCNT7Q6ZNI0 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GCNT7Q6ZNI0 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GCNT7Q6ZNI0 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GCNT7Q6ZNI0 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GCNT7Q6ZNI0 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GCNT7Q6ZNI0 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GCNT7Q6ZNI0 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GCNT7Q6ZNI0 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GCNT7Q6ZNI0 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GCNT7Q6ZNI0 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GCNT7Q6ZNI0 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GCNT7Q6ZNI0 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GCNT7Q6ZNI0 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
GCNT7Q6ZNI0 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GCNT7Q6ZNI0 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GCNT7Q6ZNI0 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GCNT7Q6ZNI0 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GCNT7Q6ZNI0 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GCNT7Q6ZNI0 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GCNT7Q6ZNI0 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
GCNT7Q6ZNI0 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GCNT7Q6ZNI0 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GCNT7Q6ZNI0 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GCNT7Q6ZNI0 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GCNT7Q6ZNI0 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GCNT7Q6ZNI0 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
GCNT7Q6ZNI0 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GCNT7Q6ZNI0 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GCNT7Q6ZNI0 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GCNT7Q6ZNI0 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GCNT7Q6ZNI0 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GCNT7Q6ZNI0 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GCNT7Q6ZNI0 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GCNT7Q6ZNI0 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GCNT7Q6ZNI0 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GCNT7Q6ZNI0 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GCNT7Q6ZNI0 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GCNT7Q6ZNI0 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GCNT7Q6ZNI0 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GCNT7Q6ZNI0 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
GCNT7Q6ZNI0 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GCNT7Q6ZNI0 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GCNT7Q6ZNI0 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GCNT7Q6ZNI0 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GCNT7Q6ZNI0 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GCNT7Q6ZNI0 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GCNT7Q6ZNI0 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GCNT7Q6ZNI0 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GCNT7Q6ZNI0 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GCNT7Q6ZNI0 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GCNT7Q6ZNI0 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GCNT7Q6ZNI0 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GCNT7Q6ZNI0 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GCNT7Q6ZNI0 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
GCNT7Q6ZNI0 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GCNT7Q6ZNI0 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
GCNT7Q6ZNI0 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GCNT7Q6ZNI0 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GCNT7Q6ZNI0 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GCNT7Q6ZNI0 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GCNT7Q6ZNI0 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GCNT7Q6ZNI0 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
GCNT7Q6ZNI0 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GCNT7Q6ZNI0 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GCNT7Q6ZNI0 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GCNT7Q6ZNI0 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GCNT7Q6ZNI0 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
GCNT7Q6ZNI0 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GCNT7Q6ZNI0 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GCNT7Q6ZNI0 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GCNT7Q6ZNI0 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GCNT7Q6ZNI0 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GCNT7Q6ZNI0 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GCNT7Q6ZNI0 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
GCNT7Q6ZNI0 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
GCNT7Q6ZNI0 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
GCNT7Q6ZNI0 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GCNT7Q6ZNI0 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms