Protein–RNA interactions for Protein: Q6WKZ4

RAB11FIP1, Rab11 family-interacting protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB11FIP1Q6WKZ4 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RAB11FIP1Q6WKZ4 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RAB11FIP1Q6WKZ4 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RAB11FIP1Q6WKZ4 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RAB11FIP1Q6WKZ4 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RAB11FIP1Q6WKZ4 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RAB11FIP1Q6WKZ4 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RAB11FIP1Q6WKZ4 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RAB11FIP1Q6WKZ4 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RAB11FIP1Q6WKZ4 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RAB11FIP1Q6WKZ4 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RAB11FIP1Q6WKZ4 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RAB11FIP1Q6WKZ4 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RAB11FIP1Q6WKZ4 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RAB11FIP1Q6WKZ4 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RAB11FIP1Q6WKZ4 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RAB11FIP1Q6WKZ4 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RAB11FIP1Q6WKZ4 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RAB11FIP1Q6WKZ4 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RAB11FIP1Q6WKZ4 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RAB11FIP1Q6WKZ4 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RAB11FIP1Q6WKZ4 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RAB11FIP1Q6WKZ4 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RAB11FIP1Q6WKZ4 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RAB11FIP1Q6WKZ4 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RAB11FIP1Q6WKZ4 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RAB11FIP1Q6WKZ4 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RAB11FIP1Q6WKZ4 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RAB11FIP1Q6WKZ4 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RAB11FIP1Q6WKZ4 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RAB11FIP1Q6WKZ4 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RAB11FIP1Q6WKZ4 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RAB11FIP1Q6WKZ4 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RAB11FIP1Q6WKZ4 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RAB11FIP1Q6WKZ4 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RAB11FIP1Q6WKZ4 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RAB11FIP1Q6WKZ4 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RAB11FIP1Q6WKZ4 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RAB11FIP1Q6WKZ4 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RAB11FIP1Q6WKZ4 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RAB11FIP1Q6WKZ4 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RAB11FIP1Q6WKZ4 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RAB11FIP1Q6WKZ4 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RAB11FIP1Q6WKZ4 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RAB11FIP1Q6WKZ4 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RAB11FIP1Q6WKZ4 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RAB11FIP1Q6WKZ4 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RAB11FIP1Q6WKZ4 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RAB11FIP1Q6WKZ4 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RAB11FIP1Q6WKZ4 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RAB11FIP1Q6WKZ4 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RAB11FIP1Q6WKZ4 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RAB11FIP1Q6WKZ4 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
RAB11FIP1Q6WKZ4 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RAB11FIP1Q6WKZ4 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RAB11FIP1Q6WKZ4 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RAB11FIP1Q6WKZ4 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RAB11FIP1Q6WKZ4 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RAB11FIP1Q6WKZ4 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RAB11FIP1Q6WKZ4 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RAB11FIP1Q6WKZ4 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
RAB11FIP1Q6WKZ4 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RAB11FIP1Q6WKZ4 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RAB11FIP1Q6WKZ4 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RAB11FIP1Q6WKZ4 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RAB11FIP1Q6WKZ4 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RAB11FIP1Q6WKZ4 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RAB11FIP1Q6WKZ4 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RAB11FIP1Q6WKZ4 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RAB11FIP1Q6WKZ4 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RAB11FIP1Q6WKZ4 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RAB11FIP1Q6WKZ4 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RAB11FIP1Q6WKZ4 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RAB11FIP1Q6WKZ4 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
RAB11FIP1Q6WKZ4 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RAB11FIP1Q6WKZ4 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RAB11FIP1Q6WKZ4 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RAB11FIP1Q6WKZ4 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RAB11FIP1Q6WKZ4 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RAB11FIP1Q6WKZ4 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RAB11FIP1Q6WKZ4 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RAB11FIP1Q6WKZ4 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RAB11FIP1Q6WKZ4 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RAB11FIP1Q6WKZ4 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RAB11FIP1Q6WKZ4 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
RAB11FIP1Q6WKZ4 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
RAB11FIP1Q6WKZ4 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RAB11FIP1Q6WKZ4 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RAB11FIP1Q6WKZ4 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RAB11FIP1Q6WKZ4 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RAB11FIP1Q6WKZ4 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RAB11FIP1Q6WKZ4 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
RAB11FIP1Q6WKZ4 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
RAB11FIP1Q6WKZ4 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RAB11FIP1Q6WKZ4 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RAB11FIP1Q6WKZ4 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
RAB11FIP1Q6WKZ4 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RAB11FIP1Q6WKZ4 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RAB11FIP1Q6WKZ4 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RAB11FIP1Q6WKZ4 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms