Protein–RNA interactions for Protein: Q6UY18

LINGO4, Leucine-rich repeat and immunoglobulin-like domain-containing nogo receptor-interacting protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 593 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINGO4Q6UY18 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
LINGO4Q6UY18 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
LINGO4Q6UY18 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
LINGO4Q6UY18 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
LINGO4Q6UY18 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
LINGO4Q6UY18 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
LINGO4Q6UY18 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
LINGO4Q6UY18 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LINGO4Q6UY18 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
LINGO4Q6UY18 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LINGO4Q6UY18 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LINGO4Q6UY18 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LINGO4Q6UY18 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
LINGO4Q6UY18 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LINGO4Q6UY18 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
LINGO4Q6UY18 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
LINGO4Q6UY18 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LINGO4Q6UY18 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LINGO4Q6UY18 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
LINGO4Q6UY18 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LINGO4Q6UY18 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
LINGO4Q6UY18 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
LINGO4Q6UY18 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
LINGO4Q6UY18 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
LINGO4Q6UY18 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
LINGO4Q6UY18 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
LINGO4Q6UY18 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
LINGO4Q6UY18 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
LINGO4Q6UY18 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
LINGO4Q6UY18 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
LINGO4Q6UY18 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
LINGO4Q6UY18 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
LINGO4Q6UY18 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
LINGO4Q6UY18 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
LINGO4Q6UY18 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
LINGO4Q6UY18 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
LINGO4Q6UY18 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
LINGO4Q6UY18 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
LINGO4Q6UY18 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
LINGO4Q6UY18 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
LINGO4Q6UY18 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
LINGO4Q6UY18 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
LINGO4Q6UY18 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
LINGO4Q6UY18 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
LINGO4Q6UY18 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
LINGO4Q6UY18 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
LINGO4Q6UY18 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
LINGO4Q6UY18 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LINGO4Q6UY18 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LINGO4Q6UY18 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LINGO4Q6UY18 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
LINGO4Q6UY18 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
LINGO4Q6UY18 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LINGO4Q6UY18 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LINGO4Q6UY18 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
LINGO4Q6UY18 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
LINGO4Q6UY18 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
LINGO4Q6UY18 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
LINGO4Q6UY18 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
LINGO4Q6UY18 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
LINGO4Q6UY18 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
LINGO4Q6UY18 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
LINGO4Q6UY18 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
LINGO4Q6UY18 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
LINGO4Q6UY18 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
LINGO4Q6UY18 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
LINGO4Q6UY18 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
LINGO4Q6UY18 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
LINGO4Q6UY18 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
LINGO4Q6UY18 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
LINGO4Q6UY18 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
LINGO4Q6UY18 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
LINGO4Q6UY18 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
LINGO4Q6UY18 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
LINGO4Q6UY18 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.19
LINGO4Q6UY18 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.19
LINGO4Q6UY18 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
LINGO4Q6UY18 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
LINGO4Q6UY18 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LINGO4Q6UY18 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
LINGO4Q6UY18 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LINGO4Q6UY18 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
LINGO4Q6UY18 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
LINGO4Q6UY18 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
LINGO4Q6UY18 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
LINGO4Q6UY18 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
LINGO4Q6UY18 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LINGO4Q6UY18 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
LINGO4Q6UY18 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LINGO4Q6UY18 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LINGO4Q6UY18 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LINGO4Q6UY18 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LINGO4Q6UY18 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LINGO4Q6UY18 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
LINGO4Q6UY18 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LINGO4Q6UY18 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LINGO4Q6UY18 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
LINGO4Q6UY18 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LINGO4Q6UY18 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LINGO4Q6UY18 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms