Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWE0

LRSAM1, E3 ubiquitin-protein ligase LRSAM1, humanhuman

Predictions only

Length 723 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRSAM1Q6UWE0 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
LRSAM1Q6UWE0 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
LRSAM1Q6UWE0 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
LRSAM1Q6UWE0 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
LRSAM1Q6UWE0 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
LRSAM1Q6UWE0 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
LRSAM1Q6UWE0 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
LRSAM1Q6UWE0 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
LRSAM1Q6UWE0 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
LRSAM1Q6UWE0 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
LRSAM1Q6UWE0 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
LRSAM1Q6UWE0 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
LRSAM1Q6UWE0 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
LRSAM1Q6UWE0 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
LRSAM1Q6UWE0 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
LRSAM1Q6UWE0 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
LRSAM1Q6UWE0 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
LRSAM1Q6UWE0 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
LRSAM1Q6UWE0 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
LRSAM1Q6UWE0 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
LRSAM1Q6UWE0 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
LRSAM1Q6UWE0 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
LRSAM1Q6UWE0 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
LRSAM1Q6UWE0 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
LRSAM1Q6UWE0 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
LRSAM1Q6UWE0 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
LRSAM1Q6UWE0 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
LRSAM1Q6UWE0 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
LRSAM1Q6UWE0 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
LRSAM1Q6UWE0 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
LRSAM1Q6UWE0 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
LRSAM1Q6UWE0 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
LRSAM1Q6UWE0 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
LRSAM1Q6UWE0 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
LRSAM1Q6UWE0 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
LRSAM1Q6UWE0 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
LRSAM1Q6UWE0 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
LRSAM1Q6UWE0 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
LRSAM1Q6UWE0 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
LRSAM1Q6UWE0 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
LRSAM1Q6UWE0 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
LRSAM1Q6UWE0 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
LRSAM1Q6UWE0 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
LRSAM1Q6UWE0 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
LRSAM1Q6UWE0 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
LRSAM1Q6UWE0 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
LRSAM1Q6UWE0 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
LRSAM1Q6UWE0 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
LRSAM1Q6UWE0 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
LRSAM1Q6UWE0 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
LRSAM1Q6UWE0 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
LRSAM1Q6UWE0 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
LRSAM1Q6UWE0 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
LRSAM1Q6UWE0 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
LRSAM1Q6UWE0 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
LRSAM1Q6UWE0 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
LRSAM1Q6UWE0 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
LRSAM1Q6UWE0 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
LRSAM1Q6UWE0 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
LRSAM1Q6UWE0 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
LRSAM1Q6UWE0 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
LRSAM1Q6UWE0 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
LRSAM1Q6UWE0 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
LRSAM1Q6UWE0 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
LRSAM1Q6UWE0 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
LRSAM1Q6UWE0 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
LRSAM1Q6UWE0 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
LRSAM1Q6UWE0 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
LRSAM1Q6UWE0 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
LRSAM1Q6UWE0 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
LRSAM1Q6UWE0 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
LRSAM1Q6UWE0 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
LRSAM1Q6UWE0 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
LRSAM1Q6UWE0 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
LRSAM1Q6UWE0 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
LRSAM1Q6UWE0 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
LRSAM1Q6UWE0 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
LRSAM1Q6UWE0 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
LRSAM1Q6UWE0 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
LRSAM1Q6UWE0 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
LRSAM1Q6UWE0 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
LRSAM1Q6UWE0 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
LRSAM1Q6UWE0 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
LRSAM1Q6UWE0 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
LRSAM1Q6UWE0 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
LRSAM1Q6UWE0 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
LRSAM1Q6UWE0 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
LRSAM1Q6UWE0 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
LRSAM1Q6UWE0 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
LRSAM1Q6UWE0 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
LRSAM1Q6UWE0 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
LRSAM1Q6UWE0 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
LRSAM1Q6UWE0 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
LRSAM1Q6UWE0 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
LRSAM1Q6UWE0 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
LRSAM1Q6UWE0 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
LRSAM1Q6UWE0 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
LRSAM1Q6UWE0 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
LRSAM1Q6UWE0 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
LRSAM1Q6UWE0 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 93 ms