Protein–RNA interactions for Protein: Q6TDU7

CASC1, Protein CASC1, humanhuman

Predictions only

Length 716 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASC1Q6TDU7 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
CASC1Q6TDU7 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CASC1Q6TDU7 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
CASC1Q6TDU7 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CASC1Q6TDU7 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CASC1Q6TDU7 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CASC1Q6TDU7 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CASC1Q6TDU7 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CASC1Q6TDU7 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CASC1Q6TDU7 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
CASC1Q6TDU7 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CASC1Q6TDU7 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CASC1Q6TDU7 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CASC1Q6TDU7 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CASC1Q6TDU7 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CASC1Q6TDU7 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CASC1Q6TDU7 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CASC1Q6TDU7 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CASC1Q6TDU7 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CASC1Q6TDU7 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CASC1Q6TDU7 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CASC1Q6TDU7 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CASC1Q6TDU7 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CASC1Q6TDU7 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CASC1Q6TDU7 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CASC1Q6TDU7 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CASC1Q6TDU7 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CASC1Q6TDU7 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CASC1Q6TDU7 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CASC1Q6TDU7 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CASC1Q6TDU7 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CASC1Q6TDU7 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CASC1Q6TDU7 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CASC1Q6TDU7 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CASC1Q6TDU7 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CASC1Q6TDU7 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CASC1Q6TDU7 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CASC1Q6TDU7 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC26.95■■□□□ 1.91
CASC1Q6TDU7 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
CASC1Q6TDU7 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
CASC1Q6TDU7 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
CASC1Q6TDU7 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.91
CASC1Q6TDU7 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
CASC1Q6TDU7 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
CASC1Q6TDU7 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
CASC1Q6TDU7 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
CASC1Q6TDU7 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
CASC1Q6TDU7 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
CASC1Q6TDU7 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CASC1Q6TDU7 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CASC1Q6TDU7 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CASC1Q6TDU7 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CASC1Q6TDU7 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CASC1Q6TDU7 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CASC1Q6TDU7 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CASC1Q6TDU7 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CASC1Q6TDU7 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
CASC1Q6TDU7 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CASC1Q6TDU7 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CASC1Q6TDU7 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CASC1Q6TDU7 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CASC1Q6TDU7 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CASC1Q6TDU7 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CASC1Q6TDU7 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CASC1Q6TDU7 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CASC1Q6TDU7 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CASC1Q6TDU7 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CASC1Q6TDU7 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CASC1Q6TDU7 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CASC1Q6TDU7 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CASC1Q6TDU7 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
CASC1Q6TDU7 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CASC1Q6TDU7 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CASC1Q6TDU7 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CASC1Q6TDU7 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CASC1Q6TDU7 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CASC1Q6TDU7 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CASC1Q6TDU7 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CASC1Q6TDU7 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CASC1Q6TDU7 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CASC1Q6TDU7 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CASC1Q6TDU7 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CASC1Q6TDU7 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CASC1Q6TDU7 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CASC1Q6TDU7 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CASC1Q6TDU7 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CASC1Q6TDU7 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CASC1Q6TDU7 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CASC1Q6TDU7 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CASC1Q6TDU7 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CASC1Q6TDU7 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CASC1Q6TDU7 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CASC1Q6TDU7 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
CASC1Q6TDU7 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
CASC1Q6TDU7 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
CASC1Q6TDU7 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
CASC1Q6TDU7 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
CASC1Q6TDU7 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
CASC1Q6TDU7 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
CASC1Q6TDU7 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms