Protein–RNA interactions for Protein: Q6SZW1

SARM1, Sterile alpha and TIR motif-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 724 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SARM1Q6SZW1 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SARM1Q6SZW1 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SARM1Q6SZW1 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SARM1Q6SZW1 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SARM1Q6SZW1 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SARM1Q6SZW1 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SARM1Q6SZW1 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SARM1Q6SZW1 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SARM1Q6SZW1 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SARM1Q6SZW1 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SARM1Q6SZW1 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SARM1Q6SZW1 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SARM1Q6SZW1 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SARM1Q6SZW1 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SARM1Q6SZW1 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SARM1Q6SZW1 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
SARM1Q6SZW1 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SARM1Q6SZW1 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SARM1Q6SZW1 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
SARM1Q6SZW1 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SARM1Q6SZW1 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SARM1Q6SZW1 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SARM1Q6SZW1 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SARM1Q6SZW1 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SARM1Q6SZW1 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SARM1Q6SZW1 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SARM1Q6SZW1 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SARM1Q6SZW1 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SARM1Q6SZW1 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SARM1Q6SZW1 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SARM1Q6SZW1 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SARM1Q6SZW1 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SARM1Q6SZW1 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SARM1Q6SZW1 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SARM1Q6SZW1 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SARM1Q6SZW1 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SARM1Q6SZW1 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SARM1Q6SZW1 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SARM1Q6SZW1 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SARM1Q6SZW1 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SARM1Q6SZW1 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SARM1Q6SZW1 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SARM1Q6SZW1 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SARM1Q6SZW1 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SARM1Q6SZW1 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SARM1Q6SZW1 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SARM1Q6SZW1 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SARM1Q6SZW1 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SARM1Q6SZW1 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SARM1Q6SZW1 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SARM1Q6SZW1 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SARM1Q6SZW1 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SARM1Q6SZW1 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SARM1Q6SZW1 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SARM1Q6SZW1 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SARM1Q6SZW1 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SARM1Q6SZW1 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
SARM1Q6SZW1 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
SARM1Q6SZW1 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SARM1Q6SZW1 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SARM1Q6SZW1 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SARM1Q6SZW1 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SARM1Q6SZW1 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SARM1Q6SZW1 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SARM1Q6SZW1 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SARM1Q6SZW1 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SARM1Q6SZW1 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SARM1Q6SZW1 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
SARM1Q6SZW1 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SARM1Q6SZW1 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SARM1Q6SZW1 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SARM1Q6SZW1 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SARM1Q6SZW1 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SARM1Q6SZW1 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SARM1Q6SZW1 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SARM1Q6SZW1 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SARM1Q6SZW1 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
SARM1Q6SZW1 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SARM1Q6SZW1 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SARM1Q6SZW1 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SARM1Q6SZW1 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SARM1Q6SZW1 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SARM1Q6SZW1 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SARM1Q6SZW1 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SARM1Q6SZW1 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SARM1Q6SZW1 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SARM1Q6SZW1 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SARM1Q6SZW1 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SARM1Q6SZW1 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SARM1Q6SZW1 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SARM1Q6SZW1 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SARM1Q6SZW1 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SARM1Q6SZW1 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SARM1Q6SZW1 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SARM1Q6SZW1 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
SARM1Q6SZW1 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SARM1Q6SZW1 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SARM1Q6SZW1 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SARM1Q6SZW1 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SARM1Q6SZW1 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms