Protein–RNA interactions for Protein: Q6NWY9

PRPF40B, Pre-mRNA-processing factor 40 homolog B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 871 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF40BQ6NWY9 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
PRPF40BQ6NWY9 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
PRPF40BQ6NWY9 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
PRPF40BQ6NWY9 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
PRPF40BQ6NWY9 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
PRPF40BQ6NWY9 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
PRPF40BQ6NWY9 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
PRPF40BQ6NWY9 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
PRPF40BQ6NWY9 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
PRPF40BQ6NWY9 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
PRPF40BQ6NWY9 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
PRPF40BQ6NWY9 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
PRPF40BQ6NWY9 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
PRPF40BQ6NWY9 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
PRPF40BQ6NWY9 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
PRPF40BQ6NWY9 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
PRPF40BQ6NWY9 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
PRPF40BQ6NWY9 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
PRPF40BQ6NWY9 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
PRPF40BQ6NWY9 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
PRPF40BQ6NWY9 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
PRPF40BQ6NWY9 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
PRPF40BQ6NWY9 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
PRPF40BQ6NWY9 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
PRPF40BQ6NWY9 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
PRPF40BQ6NWY9 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
PRPF40BQ6NWY9 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
PRPF40BQ6NWY9 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
PRPF40BQ6NWY9 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
PRPF40BQ6NWY9 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC27.83■■■□□ 2.05
PRPF40BQ6NWY9 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
PRPF40BQ6NWY9 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
PRPF40BQ6NWY9 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
PRPF40BQ6NWY9 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
PRPF40BQ6NWY9 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
PRPF40BQ6NWY9 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
PRPF40BQ6NWY9 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
PRPF40BQ6NWY9 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
PRPF40BQ6NWY9 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
PRPF40BQ6NWY9 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
PRPF40BQ6NWY9 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
PRPF40BQ6NWY9 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
PRPF40BQ6NWY9 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
PRPF40BQ6NWY9 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
PRPF40BQ6NWY9 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
PRPF40BQ6NWY9 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
PRPF40BQ6NWY9 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
PRPF40BQ6NWY9 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
PRPF40BQ6NWY9 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
PRPF40BQ6NWY9 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
PRPF40BQ6NWY9 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
PRPF40BQ6NWY9 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
PRPF40BQ6NWY9 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
PRPF40BQ6NWY9 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
PRPF40BQ6NWY9 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
PRPF40BQ6NWY9 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
PRPF40BQ6NWY9 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
PRPF40BQ6NWY9 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
PRPF40BQ6NWY9 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
PRPF40BQ6NWY9 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
PRPF40BQ6NWY9 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
PRPF40BQ6NWY9 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC27.8■■■□□ 2.04
PRPF40BQ6NWY9 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
PRPF40BQ6NWY9 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
PRPF40BQ6NWY9 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
PRPF40BQ6NWY9 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
PRPF40BQ6NWY9 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
PRPF40BQ6NWY9 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
PRPF40BQ6NWY9 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
PRPF40BQ6NWY9 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
PRPF40BQ6NWY9 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
PRPF40BQ6NWY9 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
PRPF40BQ6NWY9 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
PRPF40BQ6NWY9 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
PRPF40BQ6NWY9 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
PRPF40BQ6NWY9 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
PRPF40BQ6NWY9 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
PRPF40BQ6NWY9 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
PRPF40BQ6NWY9 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
PRPF40BQ6NWY9 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
PRPF40BQ6NWY9 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
PRPF40BQ6NWY9 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
PRPF40BQ6NWY9 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
PRPF40BQ6NWY9 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
PRPF40BQ6NWY9 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
PRPF40BQ6NWY9 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
PRPF40BQ6NWY9 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
PRPF40BQ6NWY9 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
PRPF40BQ6NWY9 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
PRPF40BQ6NWY9 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC27.78■■■□□ 2.04
PRPF40BQ6NWY9 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC27.77■■■□□ 2.04
PRPF40BQ6NWY9 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC27.77■■■□□ 2.04
PRPF40BQ6NWY9 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
PRPF40BQ6NWY9 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
PRPF40BQ6NWY9 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
PRPF40BQ6NWY9 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
PRPF40BQ6NWY9 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
PRPF40BQ6NWY9 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
PRPF40BQ6NWY9 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
PRPF40BQ6NWY9 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms