Protein–RNA interactions for Protein: Q674R7

ATG9B, Autophagy-related protein 9B, humanhuman

Predictions only

Length 924 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG9BQ674R7 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ATG9BQ674R7 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ATG9BQ674R7 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ATG9BQ674R7 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ATG9BQ674R7 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ATG9BQ674R7 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ATG9BQ674R7 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ATG9BQ674R7 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ATG9BQ674R7 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ATG9BQ674R7 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ATG9BQ674R7 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ATG9BQ674R7 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ATG9BQ674R7 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ATG9BQ674R7 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ATG9BQ674R7 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ATG9BQ674R7 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ATG9BQ674R7 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ATG9BQ674R7 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ATG9BQ674R7 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ATG9BQ674R7 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ATG9BQ674R7 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
ATG9BQ674R7 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ATG9BQ674R7 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ATG9BQ674R7 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
ATG9BQ674R7 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ATG9BQ674R7 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ATG9BQ674R7 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ATG9BQ674R7 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.03
ATG9BQ674R7 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
ATG9BQ674R7 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ATG9BQ674R7 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ATG9BQ674R7 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ATG9BQ674R7 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ATG9BQ674R7 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ATG9BQ674R7 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ATG9BQ674R7 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ATG9BQ674R7 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ATG9BQ674R7 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ATG9BQ674R7 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ATG9BQ674R7 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ATG9BQ674R7 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ATG9BQ674R7 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
ATG9BQ674R7 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ATG9BQ674R7 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ATG9BQ674R7 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ATG9BQ674R7 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ATG9BQ674R7 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ATG9BQ674R7 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ATG9BQ674R7 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ATG9BQ674R7 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ATG9BQ674R7 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ATG9BQ674R7 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ATG9BQ674R7 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ATG9BQ674R7 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATG9BQ674R7 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATG9BQ674R7 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATG9BQ674R7 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATG9BQ674R7 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATG9BQ674R7 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATG9BQ674R7 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATG9BQ674R7 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATG9BQ674R7 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATG9BQ674R7 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATG9BQ674R7 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ATG9BQ674R7 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ATG9BQ674R7 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
ATG9BQ674R7 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATG9BQ674R7 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATG9BQ674R7 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATG9BQ674R7 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATG9BQ674R7 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATG9BQ674R7 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATG9BQ674R7 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATG9BQ674R7 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATG9BQ674R7 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATG9BQ674R7 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATG9BQ674R7 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATG9BQ674R7 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATG9BQ674R7 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATG9BQ674R7 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATG9BQ674R7 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATG9BQ674R7 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATG9BQ674R7 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATG9BQ674R7 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATG9BQ674R7 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATG9BQ674R7 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
ATG9BQ674R7 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATG9BQ674R7 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
ATG9BQ674R7 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
ATG9BQ674R7 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
ATG9BQ674R7 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
ATG9BQ674R7 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
ATG9BQ674R7 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATG9BQ674R7 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATG9BQ674R7 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATG9BQ674R7 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATG9BQ674R7 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATG9BQ674R7 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
ATG9BQ674R7 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
ATG9BQ674R7 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16 ms