Protein–RNA interactions for Protein: Q658K8

EEF1DP3, Putative elongation factor 1-delta-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 133 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EEF1DP3Q658K8 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
EEF1DP3Q658K8 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
EEF1DP3Q658K8 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
EEF1DP3Q658K8 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
EEF1DP3Q658K8 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
EEF1DP3Q658K8 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
EEF1DP3Q658K8 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
EEF1DP3Q658K8 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
EEF1DP3Q658K8 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
EEF1DP3Q658K8 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
EEF1DP3Q658K8 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
EEF1DP3Q658K8 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
EEF1DP3Q658K8 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
EEF1DP3Q658K8 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
EEF1DP3Q658K8 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
EEF1DP3Q658K8 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
EEF1DP3Q658K8 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
EEF1DP3Q658K8 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
EEF1DP3Q658K8 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
EEF1DP3Q658K8 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
EEF1DP3Q658K8 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
EEF1DP3Q658K8 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
EEF1DP3Q658K8 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
EEF1DP3Q658K8 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
EEF1DP3Q658K8 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
EEF1DP3Q658K8 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
EEF1DP3Q658K8 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
EEF1DP3Q658K8 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
EEF1DP3Q658K8 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
EEF1DP3Q658K8 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
EEF1DP3Q658K8 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
EEF1DP3Q658K8 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
EEF1DP3Q658K8 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
EEF1DP3Q658K8 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
EEF1DP3Q658K8 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.12■■□□□ 1.45
EEF1DP3Q658K8 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
EEF1DP3Q658K8 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
EEF1DP3Q658K8 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
EEF1DP3Q658K8 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
EEF1DP3Q658K8 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
EEF1DP3Q658K8 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
EEF1DP3Q658K8 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
EEF1DP3Q658K8 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
EEF1DP3Q658K8 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
EEF1DP3Q658K8 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
EEF1DP3Q658K8 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
EEF1DP3Q658K8 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
EEF1DP3Q658K8 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
EEF1DP3Q658K8 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
EEF1DP3Q658K8 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
EEF1DP3Q658K8 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
EEF1DP3Q658K8 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
EEF1DP3Q658K8 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
EEF1DP3Q658K8 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
EEF1DP3Q658K8 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
EEF1DP3Q658K8 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
EEF1DP3Q658K8 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
EEF1DP3Q658K8 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
EEF1DP3Q658K8 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
EEF1DP3Q658K8 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
EEF1DP3Q658K8 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
EEF1DP3Q658K8 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
EEF1DP3Q658K8 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
EEF1DP3Q658K8 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
EEF1DP3Q658K8 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
EEF1DP3Q658K8 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
EEF1DP3Q658K8 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
EEF1DP3Q658K8 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
EEF1DP3Q658K8 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
EEF1DP3Q658K8 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
EEF1DP3Q658K8 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
EEF1DP3Q658K8 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
EEF1DP3Q658K8 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
EEF1DP3Q658K8 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC24.09■■□□□ 1.45
EEF1DP3Q658K8 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
EEF1DP3Q658K8 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
EEF1DP3Q658K8 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
EEF1DP3Q658K8 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
EEF1DP3Q658K8 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
EEF1DP3Q658K8 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
EEF1DP3Q658K8 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
EEF1DP3Q658K8 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
EEF1DP3Q658K8 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
EEF1DP3Q658K8 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
EEF1DP3Q658K8 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
EEF1DP3Q658K8 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
EEF1DP3Q658K8 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
EEF1DP3Q658K8 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
EEF1DP3Q658K8 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
EEF1DP3Q658K8 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
EEF1DP3Q658K8 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
EEF1DP3Q658K8 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
EEF1DP3Q658K8 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
EEF1DP3Q658K8 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
EEF1DP3Q658K8 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
EEF1DP3Q658K8 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
EEF1DP3Q658K8 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
EEF1DP3Q658K8 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
EEF1DP3Q658K8 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
EEF1DP3Q658K8 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms