Protein–RNA interactions for Protein: Q5JT25

RAB41, Ras-related protein Rab-41, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB41Q5JT25 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RAB41Q5JT25 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RAB41Q5JT25 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RAB41Q5JT25 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RAB41Q5JT25 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RAB41Q5JT25 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RAB41Q5JT25 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RAB41Q5JT25 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RAB41Q5JT25 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
RAB41Q5JT25 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RAB41Q5JT25 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RAB41Q5JT25 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RAB41Q5JT25 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RAB41Q5JT25 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RAB41Q5JT25 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RAB41Q5JT25 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RAB41Q5JT25 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
RAB41Q5JT25 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
RAB41Q5JT25 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RAB41Q5JT25 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RAB41Q5JT25 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RAB41Q5JT25 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RAB41Q5JT25 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RAB41Q5JT25 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RAB41Q5JT25 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RAB41Q5JT25 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RAB41Q5JT25 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RAB41Q5JT25 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RAB41Q5JT25 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RAB41Q5JT25 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
RAB41Q5JT25 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
RAB41Q5JT25 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RAB41Q5JT25 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RAB41Q5JT25 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RAB41Q5JT25 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RAB41Q5JT25 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RAB41Q5JT25 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RAB41Q5JT25 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RAB41Q5JT25 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RAB41Q5JT25 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
RAB41Q5JT25 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RAB41Q5JT25 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RAB41Q5JT25 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
RAB41Q5JT25 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
RAB41Q5JT25 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RAB41Q5JT25 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RAB41Q5JT25 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RAB41Q5JT25 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RAB41Q5JT25 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RAB41Q5JT25 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
RAB41Q5JT25 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RAB41Q5JT25 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RAB41Q5JT25 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RAB41Q5JT25 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RAB41Q5JT25 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RAB41Q5JT25 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RAB41Q5JT25 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RAB41Q5JT25 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RAB41Q5JT25 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RAB41Q5JT25 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RAB41Q5JT25 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RAB41Q5JT25 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
RAB41Q5JT25 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RAB41Q5JT25 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
RAB41Q5JT25 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RAB41Q5JT25 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RAB41Q5JT25 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RAB41Q5JT25 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RAB41Q5JT25 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RAB41Q5JT25 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RAB41Q5JT25 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RAB41Q5JT25 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RAB41Q5JT25 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RAB41Q5JT25 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RAB41Q5JT25 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RAB41Q5JT25 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RAB41Q5JT25 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RAB41Q5JT25 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RAB41Q5JT25 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RAB41Q5JT25 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RAB41Q5JT25 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RAB41Q5JT25 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RAB41Q5JT25 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RAB41Q5JT25 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RAB41Q5JT25 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RAB41Q5JT25 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RAB41Q5JT25 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RAB41Q5JT25 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RAB41Q5JT25 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RAB41Q5JT25 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RAB41Q5JT25 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RAB41Q5JT25 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RAB41Q5JT25 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RAB41Q5JT25 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RAB41Q5JT25 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RAB41Q5JT25 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RAB41Q5JT25 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RAB41Q5JT25 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RAB41Q5JT25 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RAB41Q5JT25 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms