Protein–RNA interactions for Protein: Q53HC0

CCDC92, Coiled-coil domain-containing protein 92, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC92Q53HC0 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC92Q53HC0 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC92Q53HC0 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC92Q53HC0 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC92Q53HC0 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC92Q53HC0 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC92Q53HC0 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC92Q53HC0 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC92Q53HC0 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC92Q53HC0 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC92Q53HC0 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC92Q53HC0 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC92Q53HC0 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC92Q53HC0 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC92Q53HC0 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC92Q53HC0 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC92Q53HC0 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC92Q53HC0 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC92Q53HC0 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC92Q53HC0 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC92Q53HC0 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC92Q53HC0 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC92Q53HC0 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC92Q53HC0 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC92Q53HC0 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC92Q53HC0 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC92Q53HC0 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC92Q53HC0 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC92Q53HC0 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC92Q53HC0 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC92Q53HC0 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC92Q53HC0 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC92Q53HC0 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC92Q53HC0 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC92Q53HC0 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC92Q53HC0 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC92Q53HC0 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC92Q53HC0 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC92Q53HC0 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC92Q53HC0 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC92Q53HC0 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC92Q53HC0 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC92Q53HC0 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC92Q53HC0 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC92Q53HC0 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC92Q53HC0 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC92Q53HC0 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC92Q53HC0 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC92Q53HC0 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC92Q53HC0 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC92Q53HC0 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC92Q53HC0 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC92Q53HC0 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC92Q53HC0 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC92Q53HC0 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC92Q53HC0 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC92Q53HC0 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC92Q53HC0 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC92Q53HC0 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC92Q53HC0 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC92Q53HC0 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC92Q53HC0 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC92Q53HC0 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC92Q53HC0 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC92Q53HC0 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC92Q53HC0 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC92Q53HC0 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC92Q53HC0 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC92Q53HC0 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC92Q53HC0 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC92Q53HC0 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC92Q53HC0 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC92Q53HC0 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC92Q53HC0 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC92Q53HC0 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC92Q53HC0 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC92Q53HC0 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC92Q53HC0 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC92Q53HC0 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC92Q53HC0 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC92Q53HC0 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC92Q53HC0 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
CCDC92Q53HC0 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
CCDC92Q53HC0 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC92Q53HC0 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC92Q53HC0 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC92Q53HC0 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC92Q53HC0 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC92Q53HC0 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC92Q53HC0 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC92Q53HC0 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC92Q53HC0 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC92Q53HC0 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC92Q53HC0 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC92Q53HC0 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC92Q53HC0 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC92Q53HC0 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC92Q53HC0 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC92Q53HC0 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC92Q53HC0 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.6 ms