Protein–RNA interactions for Protein: Q504Y2

PKDCC, Extracellular tyrosine-protein kinase PKDCC, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKDCCQ504Y2 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PKDCCQ504Y2 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PKDCCQ504Y2 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PKDCCQ504Y2 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PKDCCQ504Y2 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PKDCCQ504Y2 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
PKDCCQ504Y2 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PKDCCQ504Y2 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PKDCCQ504Y2 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PKDCCQ504Y2 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PKDCCQ504Y2 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PKDCCQ504Y2 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
PKDCCQ504Y2 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PKDCCQ504Y2 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PKDCCQ504Y2 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
PKDCCQ504Y2 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PKDCCQ504Y2 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PKDCCQ504Y2 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PKDCCQ504Y2 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PKDCCQ504Y2 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PKDCCQ504Y2 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PKDCCQ504Y2 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PKDCCQ504Y2 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PKDCCQ504Y2 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PKDCCQ504Y2 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PKDCCQ504Y2 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PKDCCQ504Y2 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PKDCCQ504Y2 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PKDCCQ504Y2 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PKDCCQ504Y2 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PKDCCQ504Y2 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PKDCCQ504Y2 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PKDCCQ504Y2 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PKDCCQ504Y2 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PKDCCQ504Y2 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PKDCCQ504Y2 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PKDCCQ504Y2 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PKDCCQ504Y2 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PKDCCQ504Y2 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PKDCCQ504Y2 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PKDCCQ504Y2 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PKDCCQ504Y2 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PKDCCQ504Y2 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PKDCCQ504Y2 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
PKDCCQ504Y2 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PKDCCQ504Y2 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PKDCCQ504Y2 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PKDCCQ504Y2 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PKDCCQ504Y2 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PKDCCQ504Y2 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
PKDCCQ504Y2 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PKDCCQ504Y2 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PKDCCQ504Y2 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PKDCCQ504Y2 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PKDCCQ504Y2 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PKDCCQ504Y2 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PKDCCQ504Y2 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PKDCCQ504Y2 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PKDCCQ504Y2 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PKDCCQ504Y2 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
PKDCCQ504Y2 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PKDCCQ504Y2 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PKDCCQ504Y2 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
PKDCCQ504Y2 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PKDCCQ504Y2 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PKDCCQ504Y2 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PKDCCQ504Y2 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PKDCCQ504Y2 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PKDCCQ504Y2 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PKDCCQ504Y2 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PKDCCQ504Y2 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PKDCCQ504Y2 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PKDCCQ504Y2 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PKDCCQ504Y2 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PKDCCQ504Y2 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PKDCCQ504Y2 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PKDCCQ504Y2 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PKDCCQ504Y2 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PKDCCQ504Y2 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
PKDCCQ504Y2 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
PKDCCQ504Y2 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
PKDCCQ504Y2 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
PKDCCQ504Y2 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
PKDCCQ504Y2 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
PKDCCQ504Y2 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.32
PKDCCQ504Y2 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PKDCCQ504Y2 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PKDCCQ504Y2 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PKDCCQ504Y2 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PKDCCQ504Y2 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PKDCCQ504Y2 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PKDCCQ504Y2 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PKDCCQ504Y2 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PKDCCQ504Y2 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PKDCCQ504Y2 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PKDCCQ504Y2 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PKDCCQ504Y2 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PKDCCQ504Y2 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PKDCCQ504Y2 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PKDCCQ504Y2 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms