Protein–RNA interactions for Protein: Q4LDG9

DNAL1, Dynein light chain 1, axonemal, humanhuman

Predictions only

Length 190 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAL1Q4LDG9 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
DNAL1Q4LDG9 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
DNAL1Q4LDG9 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
DNAL1Q4LDG9 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
DNAL1Q4LDG9 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
DNAL1Q4LDG9 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
DNAL1Q4LDG9 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
DNAL1Q4LDG9 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
DNAL1Q4LDG9 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
DNAL1Q4LDG9 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
DNAL1Q4LDG9 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
DNAL1Q4LDG9 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
DNAL1Q4LDG9 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
DNAL1Q4LDG9 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
DNAL1Q4LDG9 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
DNAL1Q4LDG9 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
DNAL1Q4LDG9 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
DNAL1Q4LDG9 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
DNAL1Q4LDG9 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
DNAL1Q4LDG9 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
DNAL1Q4LDG9 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
DNAL1Q4LDG9 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
DNAL1Q4LDG9 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
DNAL1Q4LDG9 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
DNAL1Q4LDG9 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
DNAL1Q4LDG9 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC21.33■■□□□ 1
DNAL1Q4LDG9 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
DNAL1Q4LDG9 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
DNAL1Q4LDG9 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
DNAL1Q4LDG9 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
DNAL1Q4LDG9 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
DNAL1Q4LDG9 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
DNAL1Q4LDG9 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
DNAL1Q4LDG9 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
DNAL1Q4LDG9 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
DNAL1Q4LDG9 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
DNAL1Q4LDG9 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
DNAL1Q4LDG9 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
DNAL1Q4LDG9 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
DNAL1Q4LDG9 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
DNAL1Q4LDG9 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
DNAL1Q4LDG9 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
DNAL1Q4LDG9 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
DNAL1Q4LDG9 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
DNAL1Q4LDG9 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
DNAL1Q4LDG9 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC21.31■■□□□ 1
DNAL1Q4LDG9 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
DNAL1Q4LDG9 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
DNAL1Q4LDG9 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
DNAL1Q4LDG9 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
DNAL1Q4LDG9 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
DNAL1Q4LDG9 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
DNAL1Q4LDG9 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
DNAL1Q4LDG9 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
DNAL1Q4LDG9 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC21.3■■□□□ 1
DNAL1Q4LDG9 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
DNAL1Q4LDG9 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
DNAL1Q4LDG9 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
DNAL1Q4LDG9 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
DNAL1Q4LDG9 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
DNAL1Q4LDG9 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
DNAL1Q4LDG9 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
DNAL1Q4LDG9 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
DNAL1Q4LDG9 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
DNAL1Q4LDG9 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
DNAL1Q4LDG9 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
DNAL1Q4LDG9 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
DNAL1Q4LDG9 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
DNAL1Q4LDG9 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
DNAL1Q4LDG9 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
DNAL1Q4LDG9 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC21.29■■□□□ 1
DNAL1Q4LDG9 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC21.29■■□□□ 1
DNAL1Q4LDG9 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
DNAL1Q4LDG9 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
DNAL1Q4LDG9 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
DNAL1Q4LDG9 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
DNAL1Q4LDG9 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
DNAL1Q4LDG9 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
DNAL1Q4LDG9 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
DNAL1Q4LDG9 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
DNAL1Q4LDG9 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
DNAL1Q4LDG9 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
DNAL1Q4LDG9 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
DNAL1Q4LDG9 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
DNAL1Q4LDG9 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
DNAL1Q4LDG9 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
DNAL1Q4LDG9 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
DNAL1Q4LDG9 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
DNAL1Q4LDG9 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
DNAL1Q4LDG9 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
DNAL1Q4LDG9 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
DNAL1Q4LDG9 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
DNAL1Q4LDG9 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
DNAL1Q4LDG9 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
DNAL1Q4LDG9 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
DNAL1Q4LDG9 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
DNAL1Q4LDG9 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
DNAL1Q4LDG9 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
DNAL1Q4LDG9 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
DNAL1Q4LDG9 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms