Protein–RNA interactions for Protein: Q3LI59

KRTAP21-2, Keratin-associated protein 21-2, humanhuman

Predictions only

Length 83 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP21-2Q3LI59 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC4.36□□□□□ -1.71
KRTAP21-2Q3LI59 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.36□□□□□ -1.71
KRTAP21-2Q3LI59 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.36□□□□□ -1.71
KRTAP21-2Q3LI59 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC4.36□□□□□ -1.71
KRTAP21-2Q3LI59 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.36□□□□□ -1.71
KRTAP21-2Q3LI59 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC4.36□□□□□ -1.71
KRTAP21-2Q3LI59 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.36□□□□□ -1.71
KRTAP21-2Q3LI59 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.36□□□□□ -1.71
KRTAP21-2Q3LI59 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC4.36□□□□□ -1.71
KRTAP21-2Q3LI59 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.36□□□□□ -1.71
KRTAP21-2Q3LI59 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC4.36□□□□□ -1.71
KRTAP21-2Q3LI59 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC4.36□□□□□ -1.71
KRTAP21-2Q3LI59 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC4.36□□□□□ -1.71
KRTAP21-2Q3LI59 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.36□□□□□ -1.71
KRTAP21-2Q3LI59 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC4.36□□□□□ -1.71
KRTAP21-2Q3LI59 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC4.36□□□□□ -1.71
KRTAP21-2Q3LI59 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
KRTAP21-2Q3LI59 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC4.36□□□□□ -1.71
KRTAP21-2Q3LI59 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC4.36□□□□□ -1.71
KRTAP21-2Q3LI59 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC4.36□□□□□ -1.71
KRTAP21-2Q3LI59 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC4.36□□□□□ -1.71
KRTAP21-2Q3LI59 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC4.36□□□□□ -1.71
KRTAP21-2Q3LI59 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC4.36□□□□□ -1.71
KRTAP21-2Q3LI59 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.36□□□□□ -1.71
KRTAP21-2Q3LI59 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC4.36□□□□□ -1.71
KRTAP21-2Q3LI59 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC4.36□□□□□ -1.71
KRTAP21-2Q3LI59 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
KRTAP21-2Q3LI59 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC4.36□□□□□ -1.71
KRTAP21-2Q3LI59 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.36□□□□□ -1.71
KRTAP21-2Q3LI59 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC4.36□□□□□ -1.71
KRTAP21-2Q3LI59 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC4.36□□□□□ -1.71
KRTAP21-2Q3LI59 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC4.36□□□□□ -1.71
KRTAP21-2Q3LI59 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.36□□□□□ -1.71
KRTAP21-2Q3LI59 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC4.36□□□□□ -1.71
KRTAP21-2Q3LI59 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.36□□□□□ -1.71
KRTAP21-2Q3LI59 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.36□□□□□ -1.71
KRTAP21-2Q3LI59 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.36□□□□□ -1.71
KRTAP21-2Q3LI59 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.36□□□□□ -1.71
KRTAP21-2Q3LI59 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC4.36□□□□□ -1.71
KRTAP21-2Q3LI59 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.36□□□□□ -1.71
KRTAP21-2Q3LI59 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.36□□□□□ -1.71
KRTAP21-2Q3LI59 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC4.36□□□□□ -1.71
KRTAP21-2Q3LI59 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.36□□□□□ -1.71
KRTAP21-2Q3LI59 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.36□□□□□ -1.71
KRTAP21-2Q3LI59 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.36□□□□□ -1.71
KRTAP21-2Q3LI59 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.36□□□□□ -1.71
KRTAP21-2Q3LI59 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.35□□□□□ -1.71
KRTAP21-2Q3LI59 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC4.35□□□□□ -1.71
KRTAP21-2Q3LI59 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.35□□□□□ -1.71
KRTAP21-2Q3LI59 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.35□□□□□ -1.71
KRTAP21-2Q3LI59 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC4.35□□□□□ -1.71
KRTAP21-2Q3LI59 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
KRTAP21-2Q3LI59 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
KRTAP21-2Q3LI59 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
KRTAP21-2Q3LI59 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC4.35□□□□□ -1.71
KRTAP21-2Q3LI59 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
KRTAP21-2Q3LI59 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.35□□□□□ -1.71
KRTAP21-2Q3LI59 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC4.35□□□□□ -1.71
KRTAP21-2Q3LI59 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
KRTAP21-2Q3LI59 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC4.35□□□□□ -1.71
KRTAP21-2Q3LI59 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC4.35□□□□□ -1.71
KRTAP21-2Q3LI59 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
KRTAP21-2Q3LI59 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
KRTAP21-2Q3LI59 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC4.35□□□□□ -1.71
KRTAP21-2Q3LI59 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.35□□□□□ -1.71
KRTAP21-2Q3LI59 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
KRTAP21-2Q3LI59 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC4.35□□□□□ -1.71
KRTAP21-2Q3LI59 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
KRTAP21-2Q3LI59 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
KRTAP21-2Q3LI59 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
KRTAP21-2Q3LI59 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC4.35□□□□□ -1.71
KRTAP21-2Q3LI59 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC4.35□□□□□ -1.71
KRTAP21-2Q3LI59 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
KRTAP21-2Q3LI59 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
KRTAP21-2Q3LI59 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
KRTAP21-2Q3LI59 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC4.35□□□□□ -1.71
KRTAP21-2Q3LI59 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
KRTAP21-2Q3LI59 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
KRTAP21-2Q3LI59 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.35□□□□□ -1.71
KRTAP21-2Q3LI59 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC4.35□□□□□ -1.71
KRTAP21-2Q3LI59 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
KRTAP21-2Q3LI59 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC4.35□□□□□ -1.71
KRTAP21-2Q3LI59 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
KRTAP21-2Q3LI59 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC4.35□□□□□ -1.71
KRTAP21-2Q3LI59 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
KRTAP21-2Q3LI59 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
KRTAP21-2Q3LI59 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC4.35□□□□□ -1.71
KRTAP21-2Q3LI59 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
KRTAP21-2Q3LI59 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
KRTAP21-2Q3LI59 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.35□□□□□ -1.71
KRTAP21-2Q3LI59 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC4.35□□□□□ -1.71
KRTAP21-2Q3LI59 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC4.35□□□□□ -1.71
KRTAP21-2Q3LI59 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
KRTAP21-2Q3LI59 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
KRTAP21-2Q3LI59 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC4.35□□□□□ -1.71
KRTAP21-2Q3LI59 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
KRTAP21-2Q3LI59 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
KRTAP21-2Q3LI59 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
KRTAP21-2Q3LI59 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
KRTAP21-2Q3LI59 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.35□□□□□ -1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms