Protein–RNA interactions for Protein: Q32P28

P3H1, Prolyl 3-hydroxylase 1, humanhuman

Predictions only

Length 736 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P3H1Q32P28 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
P3H1Q32P28 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
P3H1Q32P28 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
P3H1Q32P28 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
P3H1Q32P28 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
P3H1Q32P28 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
P3H1Q32P28 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
P3H1Q32P28 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
P3H1Q32P28 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
P3H1Q32P28 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
P3H1Q32P28 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
P3H1Q32P28 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
P3H1Q32P28 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
P3H1Q32P28 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
P3H1Q32P28 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
P3H1Q32P28 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
P3H1Q32P28 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
P3H1Q32P28 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
P3H1Q32P28 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
P3H1Q32P28 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
P3H1Q32P28 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
P3H1Q32P28 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
P3H1Q32P28 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
P3H1Q32P28 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
P3H1Q32P28 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
P3H1Q32P28 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
P3H1Q32P28 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
P3H1Q32P28 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
P3H1Q32P28 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
P3H1Q32P28 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
P3H1Q32P28 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
P3H1Q32P28 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
P3H1Q32P28 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
P3H1Q32P28 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
P3H1Q32P28 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
P3H1Q32P28 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
P3H1Q32P28 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
P3H1Q32P28 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
P3H1Q32P28 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
P3H1Q32P28 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
P3H1Q32P28 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
P3H1Q32P28 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
P3H1Q32P28 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
P3H1Q32P28 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
P3H1Q32P28 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
P3H1Q32P28 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
P3H1Q32P28 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
P3H1Q32P28 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
P3H1Q32P28 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
P3H1Q32P28 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
P3H1Q32P28 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
P3H1Q32P28 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
P3H1Q32P28 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
P3H1Q32P28 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
P3H1Q32P28 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
P3H1Q32P28 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
P3H1Q32P28 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
P3H1Q32P28 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
P3H1Q32P28 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
P3H1Q32P28 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
P3H1Q32P28 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
P3H1Q32P28 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
P3H1Q32P28 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
P3H1Q32P28 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
P3H1Q32P28 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
P3H1Q32P28 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
P3H1Q32P28 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
P3H1Q32P28 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
P3H1Q32P28 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
P3H1Q32P28 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
P3H1Q32P28 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
P3H1Q32P28 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
P3H1Q32P28 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
P3H1Q32P28 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
P3H1Q32P28 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
P3H1Q32P28 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
P3H1Q32P28 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
P3H1Q32P28 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
P3H1Q32P28 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
P3H1Q32P28 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
P3H1Q32P28 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
P3H1Q32P28 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
P3H1Q32P28 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
P3H1Q32P28 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
P3H1Q32P28 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
P3H1Q32P28 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
P3H1Q32P28 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
P3H1Q32P28 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
P3H1Q32P28 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
P3H1Q32P28 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
P3H1Q32P28 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
P3H1Q32P28 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
P3H1Q32P28 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
P3H1Q32P28 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
P3H1Q32P28 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
P3H1Q32P28 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
P3H1Q32P28 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
P3H1Q32P28 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
P3H1Q32P28 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
P3H1Q32P28 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms