Protein–RNA interactions for Protein: Q2M329

CCDC96, Coiled-coil domain-containing protein 96, humanhuman

Predictions only

Length 555 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC96Q2M329 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CCDC96Q2M329 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CCDC96Q2M329 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CCDC96Q2M329 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CCDC96Q2M329 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CCDC96Q2M329 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CCDC96Q2M329 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
CCDC96Q2M329 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
CCDC96Q2M329 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CCDC96Q2M329 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CCDC96Q2M329 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CCDC96Q2M329 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CCDC96Q2M329 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
CCDC96Q2M329 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CCDC96Q2M329 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
CCDC96Q2M329 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CCDC96Q2M329 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CCDC96Q2M329 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CCDC96Q2M329 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CCDC96Q2M329 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CCDC96Q2M329 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CCDC96Q2M329 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CCDC96Q2M329 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CCDC96Q2M329 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CCDC96Q2M329 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CCDC96Q2M329 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CCDC96Q2M329 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CCDC96Q2M329 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
CCDC96Q2M329 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CCDC96Q2M329 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCDC96Q2M329 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCDC96Q2M329 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCDC96Q2M329 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCDC96Q2M329 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCDC96Q2M329 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCDC96Q2M329 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCDC96Q2M329 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCDC96Q2M329 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCDC96Q2M329 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCDC96Q2M329 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
CCDC96Q2M329 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CCDC96Q2M329 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CCDC96Q2M329 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CCDC96Q2M329 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CCDC96Q2M329 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CCDC96Q2M329 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CCDC96Q2M329 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CCDC96Q2M329 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CCDC96Q2M329 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CCDC96Q2M329 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CCDC96Q2M329 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CCDC96Q2M329 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
CCDC96Q2M329 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CCDC96Q2M329 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CCDC96Q2M329 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CCDC96Q2M329 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CCDC96Q2M329 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CCDC96Q2M329 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CCDC96Q2M329 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CCDC96Q2M329 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CCDC96Q2M329 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CCDC96Q2M329 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CCDC96Q2M329 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CCDC96Q2M329 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CCDC96Q2M329 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCDC96Q2M329 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCDC96Q2M329 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCDC96Q2M329 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCDC96Q2M329 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCDC96Q2M329 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCDC96Q2M329 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCDC96Q2M329 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCDC96Q2M329 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCDC96Q2M329 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCDC96Q2M329 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCDC96Q2M329 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCDC96Q2M329 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCDC96Q2M329 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCDC96Q2M329 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCDC96Q2M329 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
CCDC96Q2M329 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCDC96Q2M329 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCDC96Q2M329 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCDC96Q2M329 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCDC96Q2M329 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCDC96Q2M329 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCDC96Q2M329 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCDC96Q2M329 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCDC96Q2M329 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CCDC96Q2M329 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CCDC96Q2M329 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CCDC96Q2M329 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CCDC96Q2M329 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CCDC96Q2M329 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CCDC96Q2M329 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CCDC96Q2M329 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CCDC96Q2M329 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CCDC96Q2M329 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CCDC96Q2M329 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CCDC96Q2M329 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms