Protein–RNA interactions for Protein: Q16647

PTGIS, Prostacyclin synthase, humanhuman

Predictions only

Length 500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGISQ16647 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PTGISQ16647 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PTGISQ16647 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PTGISQ16647 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
PTGISQ16647 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PTGISQ16647 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
PTGISQ16647 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PTGISQ16647 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PTGISQ16647 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PTGISQ16647 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PTGISQ16647 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PTGISQ16647 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PTGISQ16647 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PTGISQ16647 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PTGISQ16647 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PTGISQ16647 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PTGISQ16647 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PTGISQ16647 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PTGISQ16647 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PTGISQ16647 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PTGISQ16647 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PTGISQ16647 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PTGISQ16647 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PTGISQ16647 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PTGISQ16647 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PTGISQ16647 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PTGISQ16647 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PTGISQ16647 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PTGISQ16647 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
PTGISQ16647 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PTGISQ16647 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PTGISQ16647 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
PTGISQ16647 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PTGISQ16647 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PTGISQ16647 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PTGISQ16647 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PTGISQ16647 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PTGISQ16647 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PTGISQ16647 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
PTGISQ16647 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PTGISQ16647 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PTGISQ16647 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PTGISQ16647 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PTGISQ16647 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PTGISQ16647 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PTGISQ16647 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PTGISQ16647 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
PTGISQ16647 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PTGISQ16647 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PTGISQ16647 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PTGISQ16647 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PTGISQ16647 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PTGISQ16647 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PTGISQ16647 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PTGISQ16647 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PTGISQ16647 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PTGISQ16647 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PTGISQ16647 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PTGISQ16647 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PTGISQ16647 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PTGISQ16647 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PTGISQ16647 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PTGISQ16647 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PTGISQ16647 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PTGISQ16647 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PTGISQ16647 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PTGISQ16647 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PTGISQ16647 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PTGISQ16647 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PTGISQ16647 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PTGISQ16647 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PTGISQ16647 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PTGISQ16647 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PTGISQ16647 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PTGISQ16647 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PTGISQ16647 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PTGISQ16647 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PTGISQ16647 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PTGISQ16647 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PTGISQ16647 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PTGISQ16647 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
PTGISQ16647 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
PTGISQ16647 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PTGISQ16647 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PTGISQ16647 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PTGISQ16647 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PTGISQ16647 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PTGISQ16647 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
PTGISQ16647 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
PTGISQ16647 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PTGISQ16647 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PTGISQ16647 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PTGISQ16647 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PTGISQ16647 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PTGISQ16647 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PTGISQ16647 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PTGISQ16647 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PTGISQ16647 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
PTGISQ16647 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
PTGISQ16647 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms