Protein–RNA interactions for Protein: Q16629

SRSF7, Serine/arginine-rich splicing factor 7, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 238 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF7Q16629 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.295e-9■■□□□ 12.2
SRSF7Q16629 MALAT1-202ENST00000534336 8708 ntBASIC7.63□□□□□ -1.191e-54■■□□□ 12.2
SRSF7Q16629 SFPQ-201ENST00000357214 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.751e-11■■□□□ 12.2
SRSF7Q16629 NRDC-211ENST00000491410 1020 ntTSL 215.71■□□□□ 0.114e-13■■□□□ 12.2
SRSF7Q16629 NRDC-201ENST00000352171 3691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.484e-13■■□□□ 12.2
SRSF7Q16629 NRDC-202ENST00000354831 3895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.64e-13■■□□□ 12.2
SRSF7Q16629 NRDC-214ENST00000544028 3819 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.664e-13■■□□□ 12.2
SRSF7Q16629 NRDC-210ENST00000485608 3149 ntTSL 25.88□□□□□ -1.474e-13■■□□□ 12.2
SRSF7Q16629 NRDC-213ENST00000539524 3417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.614e-13■■□□□ 12.2
SRSF7Q16629 GS1-600G8.3-201ENST00000431486 2249 ntTSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.163e-8■■□□□ 12.2
SRSF7Q16629 SRRM2-222ENST00000575009 1146 ntTSL 520.61■□□□□ 0.892e-6■■□□□ 12.2
SRSF7Q16629 SRRM2-229ENST00000576894 2210 ntTSL 1 (best)17.79■□□□□ 0.442e-6■■□□□ 12.2
SRSF7Q16629 SRRM2-205ENST00000570971 1132 ntTSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.662e-6■■□□□ 12.2
SRSF7Q16629 SRRM2-224ENST00000575870 696 ntTSL 39.02□□□□□ -0.972e-6■■□□□ 12.2
SRSF7Q16629 SRRM2-203ENST00000570655 575 ntTSL 27.08□□□□□ -1.282e-6■■□□□ 12.2
SRSF7Q16629 SRRM2-214ENST00000573451 441 ntTSL 36.11□□□□□ -1.432e-6■■□□□ 12.2
SRSF7Q16629 SRRM2-215ENST00000573498 994 ntTSL 34.85□□□□□ -1.632e-6■■□□□ 12.2
SRSF7Q16629 MLLT6-208ENST00000619356 3868 ntTSL 1 (best)12.26□□□□□ -0.451e-22■■□□□ 12.2
SRSF7Q16629 MLLT6-205ENST00000615741 2937 nt11.56□□□□□ -0.561e-22■■□□□ 12.2
SRSF7Q16629 MLLT6-204ENST00000615441 395 ntTSL 310.04□□□□□ -0.81e-22■■□□□ 12.2
SRSF7Q16629 HNRNPC-204ENST00000449098 1599 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.864e-7■■□□□ 12.1
SRSF7Q16629 HNRNPC-206ENST00000553444 724 ntTSL 29.04□□□□□ -0.964e-7■■□□□ 12.1
SRSF7Q16629 HNRNPC-227ENST00000556897 1252 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.291e-12■■□□□ 12.1
SRSF7Q16629 HNRNPC-229ENST00000557157 698 ntTSL 53.93□□□□□ -1.784e-7■■□□□ 12.1
SRSF7Q16629 LIMD1-AS1-202ENST00000429798 955 ntTSL 1 (best)8.49□□□□□ -1.054e-10■■□□□ 12.1
SRSF7Q16629 ANP32A-204ENST00000480858 352 ntTSL 1 (best)11.68□□□□□ -0.541e-7■■□□□ 12.1
SRSF7Q16629 EXOC3L4-205ENST00000560102 563 ntTSL 317.14■□□□□ 0.332e-8■■□□□ 12.1
SRSF7Q16629 NAP1L1-220ENST00000551524 460 ntTSL 26.19□□□□□ -1.423e-20■■□□□ 12.1
SRSF7Q16629 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.248e-7■■□□□ 12.1
SRSF7Q16629 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.158e-7■■□□□ 12.1
SRSF7Q16629 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.078e-7■■□□□ 12.1
SRSF7Q16629 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.118e-7■■□□□ 12.1
SRSF7Q16629 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.198e-7■■□□□ 12.1
SRSF7Q16629 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.248e-7■■□□□ 12.1
SRSF7Q16629 SLC3A2-220ENST00000542922 2174 ntTSL 211.62□□□□□ -0.558e-7■■□□□ 12.1
SRSF7Q16629 SLC3A2-212ENST00000538682 1368 ntTSL 1 (best)11.61□□□□□ -0.558e-7■■□□□ 12.1
SRSF7Q16629 SLC3A2-205ENST00000457660 873 ntTSL 59.97□□□□□ -0.818e-7■■□□□ 12.1
SRSF7Q16629 SLC3A2-217ENST00000541425 595 ntTSL 58.78□□□□□ -18e-7■■□□□ 12.1
SRSF7Q16629 SLC3A2-215ENST00000539891 1300 ntTSL 1 (best)8.54□□□□□ -1.048e-7■■□□□ 12.1
SRSF7Q16629 SLC3A2-207ENST00000535768 597 ntTSL 58.08□□□□□ -1.128e-7■■□□□ 12.1
SRSF7Q16629 SLC3A2-223ENST00000546312 564 ntTSL 28.02□□□□□ -1.138e-7■■□□□ 12.1
SRSF7Q16629 SLC3A2-209ENST00000537508 583 ntTSL 27.37□□□□□ -1.238e-7■■□□□ 12.1
SRSF7Q16629 SLC3A2-214ENST00000539507 534 ntTSL 35.18□□□□□ -1.588e-7■■□□□ 12.1
SRSF7Q16629 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.137e-7■■□□□ 12
SRSF7Q16629 PPM1G-202ENST00000472077 3752 ntTSL 27.81□□□□□ -1.167e-7■■□□□ 12
SRSF7Q16629 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.471e-11■■□□□ 12
SRSF7Q16629 SAMD1-201ENST00000269724 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 515.43■□□□□ 0.061e-11■■□□□ 12
SRSF7Q16629 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.812e-6■■□□□ 11.9
SRSF7Q16629 RANBP1-213ENST00000486575 2177 ntTSL 218.32■□□□□ 0.522e-6■■□□□ 11.9
SRSF7Q16629 RANBP1-210ENST00000435265 1879 ntTSL 216.34■□□□□ 0.212e-6■■□□□ 11.9
SRSF7Q16629 GIGYF1-202ENST00000464111 656 ntTSL 314.69□□□□□ -0.062e-6■■□□□ 11.9
SRSF7Q16629 RANBP1-207ENST00000423859 832 ntTSL 314.42□□□□□ -0.12e-6■■□□□ 11.9
SRSF7Q16629 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.192e-6■■□□□ 11.9
SRSF7Q16629 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.262e-6■■□□□ 11.9
SRSF7Q16629 RANBP1-205ENST00000418705 932 ntTSL 313.07□□□□□ -0.322e-6■■□□□ 11.9
SRSF7Q16629 GIGYF1-203ENST00000471340 478 ntTSL 512.92□□□□□ -0.342e-6■■□□□ 11.9
SRSF7Q16629 RANBP1-208ENST00000430524 1389 ntTSL 3 BASIC12.02□□□□□ -0.492e-6■■□□□ 11.9
SRSF7Q16629 RANBP1-201ENST00000331821 837 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.52e-6■■□□□ 11.9
SRSF7Q16629 RANBP1-211ENST00000448394 688 ntTSL 211.61□□□□□ -0.552e-6■■□□□ 11.9
SRSF7Q16629 IWS1-201ENST00000295321 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.612e-6■■□□□ 11.9
SRSF7Q16629 AQP3-205ENST00000494313 1505 ntTSL 211.13□□□□□ -0.632e-6■■□□□ 11.9
SRSF7Q16629 AQP3-204ENST00000493581 2911 ntTSL 211.08□□□□□ -0.642e-6■■□□□ 11.9
SRSF7Q16629 ANKRD10-207ENST00000475809 446 ntTSL 23.58□□□□□ -1.842e-6■■□□□ 11.9
SRSF7Q16629 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.134e-6■■□□□ 11.9
SRSF7Q16629 ZCCHC17-202ENST00000373714 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.314e-6■■□□□ 11.9
SRSF7Q16629 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.394e-6■■□□□ 11.9
SRSF7Q16629 ZCCHC17-204ENST00000546109 1705 ntTSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.574e-6■■□□□ 11.9
SRSF7Q16629 ZCCHC17-201ENST00000344147 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.574e-6■■□□□ 11.9
SRSF7Q16629 ZCCHC17-207ENST00000616859 1458 ntTSL 4 BASIC11.03□□□□□ -0.644e-6■■□□□ 11.9
SRSF7Q16629 ZCCHC17-208ENST00000618216 1489 ntTSL 3 BASIC11.03□□□□□ -0.644e-6■■□□□ 11.9
SRSF7Q16629 ZCCHC17-209ENST00000627541 1158 ntTSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.354e-6■■□□□ 11.9
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SRSF7Q16629 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.367e-7■■□□□ 11.9
SRSF7Q16629 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.497e-7■■□□□ 11.9
SRSF7Q16629 STMN1-206ENST00000455785 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.647e-7■■□□□ 11.9
SRSF7Q16629 STMN1-202ENST00000374291 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.16□□□□□ -1.587e-7■■□□□ 11.9
SRSF7Q16629 STMN1-207ENST00000465604 2947 ntTSL 1 (best)2.98□□□□□ -1.937e-7■■□□□ 11.9
SRSF7Q16629 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.531e-7■■□□□ 11.9
SRSF7Q16629 ARFGAP2-227ENST00000533243 1558 ntTSL 216.68■□□□□ 0.261e-7■■□□□ 11.9
SRSF7Q16629 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.075e-13■■□□□ 11.9
SRSF7Q16629 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.075e-13■■□□□ 11.9
SRSF7Q16629 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.011e-7■■□□□ 11.9
SRSF7Q16629 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.061e-7■■□□□ 11.9
SRSF7Q16629 DDX17-203ENST00000403230 2322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best)14.06□□□□□ -0.165e-13■■□□□ 11.9
SRSF7Q16629 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.281e-7■■□□□ 11.9
SRSF7Q16629 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.311e-7■■□□□ 11.9
SRSF7Q16629 DDX17-209ENST00000479734 441 ntTSL 412.6□□□□□ -0.395e-13■■□□□ 11.9
SRSF7Q16629 DDX17-202ENST00000396821 4791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.425e-13■■□□□ 11.9
SRSF7Q16629 ARFGAP2-207ENST00000525398 1000 ntTSL 312.03□□□□□ -0.481e-7■■□□□ 11.9
SRSF7Q16629 ARFGAP2-220ENST00000529455 840 ntTSL 511.99□□□□□ -0.491e-7■■□□□ 11.9
SRSF7Q16629 ARFGAP2-224ENST00000531750 649 ntTSL 411.52□□□□□ -0.571e-7■■□□□ 11.9
SRSF7Q16629 ARFGAP2-206ENST00000525314 785 ntTSL 311.52□□□□□ -0.571e-7■■□□□ 11.9
SRSF7Q16629 ARFGAP2-201ENST00000395449 1772 ntTSL 511.31□□□□□ -0.61e-7■■□□□ 11.9
SRSF7Q16629 WDR6-201ENST00000395474 4401 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.671e-7■■□□□ 11.9
SRSF7Q16629 ARFGAP2-226ENST00000532478 940 ntTSL 510.79□□□□□ -0.681e-7■■□□□ 11.9
SRSF7Q16629 WDR6-211ENST00000471162 3565 ntTSL 1 (best)10.77□□□□□ -0.691e-7■■□□□ 11.9
SRSF7Q16629 DDX17-201ENST00000216019 6441 ntTSL 1 (best)10.69□□□□□ -0.75e-13■■□□□ 11.9
SRSF7Q16629 ARFGAP2-214ENST00000527927 850 ntTSL 510.13□□□□□ -0.791e-7■■□□□ 11.9
SRSF7Q16629 WDR6-204ENST00000420783 3656 ntTSL 1 (best)10.09□□□□□ -0.791e-7■■□□□ 11.9
SRSF7Q16629 ARFGAP2-211ENST00000526948 556 ntTSL 210□□□□□ -0.811e-7■■□□□ 11.9
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