Protein–RNA interactions for Protein: Q16281

CNGA3, Cyclic nucleotide-gated cation channel alpha-3, humanhuman

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Length 694 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGA3Q16281 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CNGA3Q16281 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CNGA3Q16281 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CNGA3Q16281 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CNGA3Q16281 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CNGA3Q16281 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CNGA3Q16281 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CNGA3Q16281 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CNGA3Q16281 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CNGA3Q16281 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CNGA3Q16281 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CNGA3Q16281 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CNGA3Q16281 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CNGA3Q16281 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CNGA3Q16281 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CNGA3Q16281 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CNGA3Q16281 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CNGA3Q16281 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CNGA3Q16281 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CNGA3Q16281 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CNGA3Q16281 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CNGA3Q16281 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CNGA3Q16281 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CNGA3Q16281 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CNGA3Q16281 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CNGA3Q16281 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CNGA3Q16281 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
CNGA3Q16281 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.19
CNGA3Q16281 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CNGA3Q16281 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CNGA3Q16281 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
CNGA3Q16281 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CNGA3Q16281 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CNGA3Q16281 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CNGA3Q16281 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CNGA3Q16281 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CNGA3Q16281 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CNGA3Q16281 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CNGA3Q16281 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CNGA3Q16281 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CNGA3Q16281 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CNGA3Q16281 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CNGA3Q16281 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CNGA3Q16281 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CNGA3Q16281 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CNGA3Q16281 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CNGA3Q16281 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CNGA3Q16281 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CNGA3Q16281 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CNGA3Q16281 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
CNGA3Q16281 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
CNGA3Q16281 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CNGA3Q16281 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CNGA3Q16281 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CNGA3Q16281 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CNGA3Q16281 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CNGA3Q16281 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CNGA3Q16281 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CNGA3Q16281 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CNGA3Q16281 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CNGA3Q16281 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CNGA3Q16281 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CNGA3Q16281 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CNGA3Q16281 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CNGA3Q16281 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CNGA3Q16281 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CNGA3Q16281 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
CNGA3Q16281 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CNGA3Q16281 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CNGA3Q16281 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CNGA3Q16281 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CNGA3Q16281 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CNGA3Q16281 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CNGA3Q16281 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CNGA3Q16281 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CNGA3Q16281 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CNGA3Q16281 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CNGA3Q16281 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CNGA3Q16281 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CNGA3Q16281 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CNGA3Q16281 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CNGA3Q16281 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CNGA3Q16281 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CNGA3Q16281 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CNGA3Q16281 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CNGA3Q16281 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CNGA3Q16281 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CNGA3Q16281 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CNGA3Q16281 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
CNGA3Q16281 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CNGA3Q16281 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CNGA3Q16281 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CNGA3Q16281 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CNGA3Q16281 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CNGA3Q16281 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CNGA3Q16281 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CNGA3Q16281 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CNGA3Q16281 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CNGA3Q16281 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CNGA3Q16281 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
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