Protein–RNA interactions for Protein: Q15059

BRD3, Bromodomain-containing protein 3, humanhuman

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Length 726 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRD3Q15059 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
BRD3Q15059 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
BRD3Q15059 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
BRD3Q15059 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
BRD3Q15059 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
BRD3Q15059 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
BRD3Q15059 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
BRD3Q15059 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
BRD3Q15059 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
BRD3Q15059 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
BRD3Q15059 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
BRD3Q15059 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
BRD3Q15059 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
BRD3Q15059 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
BRD3Q15059 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
BRD3Q15059 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
BRD3Q15059 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
BRD3Q15059 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
BRD3Q15059 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
BRD3Q15059 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
BRD3Q15059 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
BRD3Q15059 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
BRD3Q15059 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
BRD3Q15059 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
BRD3Q15059 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
BRD3Q15059 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
BRD3Q15059 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
BRD3Q15059 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
BRD3Q15059 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
BRD3Q15059 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
BRD3Q15059 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
BRD3Q15059 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
BRD3Q15059 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
BRD3Q15059 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
BRD3Q15059 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
BRD3Q15059 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
BRD3Q15059 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
BRD3Q15059 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
BRD3Q15059 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
BRD3Q15059 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
BRD3Q15059 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
BRD3Q15059 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
BRD3Q15059 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
BRD3Q15059 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
BRD3Q15059 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
BRD3Q15059 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
BRD3Q15059 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
BRD3Q15059 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
BRD3Q15059 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
BRD3Q15059 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
BRD3Q15059 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
BRD3Q15059 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
BRD3Q15059 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
BRD3Q15059 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
BRD3Q15059 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
BRD3Q15059 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
BRD3Q15059 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
BRD3Q15059 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
BRD3Q15059 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
BRD3Q15059 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
BRD3Q15059 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
BRD3Q15059 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
BRD3Q15059 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
BRD3Q15059 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
BRD3Q15059 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
BRD3Q15059 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
BRD3Q15059 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
BRD3Q15059 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
BRD3Q15059 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
BRD3Q15059 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
BRD3Q15059 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
BRD3Q15059 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
BRD3Q15059 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
BRD3Q15059 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
BRD3Q15059 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
BRD3Q15059 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
BRD3Q15059 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
BRD3Q15059 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
BRD3Q15059 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
BRD3Q15059 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
BRD3Q15059 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
BRD3Q15059 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
BRD3Q15059 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
BRD3Q15059 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
BRD3Q15059 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
BRD3Q15059 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
BRD3Q15059 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
BRD3Q15059 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
BRD3Q15059 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
BRD3Q15059 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
BRD3Q15059 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
BRD3Q15059 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
BRD3Q15059 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
BRD3Q15059 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
BRD3Q15059 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
BRD3Q15059 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
BRD3Q15059 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
BRD3Q15059 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
BRD3Q15059 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
BRD3Q15059 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
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