Protein–RNA interactions for Protein: Q14CN4

KRT72, Keratin, type II cytoskeletal 72, humanhuman

Predictions only

Length 511 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT72Q14CN4 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
KRT72Q14CN4 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
KRT72Q14CN4 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
KRT72Q14CN4 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
KRT72Q14CN4 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
KRT72Q14CN4 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
KRT72Q14CN4 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
KRT72Q14CN4 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
KRT72Q14CN4 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
KRT72Q14CN4 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
KRT72Q14CN4 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
KRT72Q14CN4 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
KRT72Q14CN4 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
KRT72Q14CN4 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
KRT72Q14CN4 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
KRT72Q14CN4 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
KRT72Q14CN4 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
KRT72Q14CN4 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
KRT72Q14CN4 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
KRT72Q14CN4 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
KRT72Q14CN4 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
KRT72Q14CN4 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
KRT72Q14CN4 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
KRT72Q14CN4 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
KRT72Q14CN4 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
KRT72Q14CN4 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
KRT72Q14CN4 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
KRT72Q14CN4 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
KRT72Q14CN4 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
KRT72Q14CN4 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
KRT72Q14CN4 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
KRT72Q14CN4 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
KRT72Q14CN4 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.03
KRT72Q14CN4 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
KRT72Q14CN4 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
KRT72Q14CN4 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
KRT72Q14CN4 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
KRT72Q14CN4 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
KRT72Q14CN4 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
KRT72Q14CN4 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
KRT72Q14CN4 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
KRT72Q14CN4 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
KRT72Q14CN4 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
KRT72Q14CN4 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
KRT72Q14CN4 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
KRT72Q14CN4 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
KRT72Q14CN4 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
KRT72Q14CN4 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
KRT72Q14CN4 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
KRT72Q14CN4 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
KRT72Q14CN4 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
KRT72Q14CN4 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
KRT72Q14CN4 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
KRT72Q14CN4 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
KRT72Q14CN4 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
KRT72Q14CN4 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
KRT72Q14CN4 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
KRT72Q14CN4 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
KRT72Q14CN4 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
KRT72Q14CN4 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
KRT72Q14CN4 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
KRT72Q14CN4 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
KRT72Q14CN4 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
KRT72Q14CN4 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
KRT72Q14CN4 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
KRT72Q14CN4 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
KRT72Q14CN4 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
KRT72Q14CN4 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
KRT72Q14CN4 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
KRT72Q14CN4 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
KRT72Q14CN4 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
KRT72Q14CN4 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
KRT72Q14CN4 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
KRT72Q14CN4 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
KRT72Q14CN4 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
KRT72Q14CN4 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
KRT72Q14CN4 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
KRT72Q14CN4 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
KRT72Q14CN4 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
KRT72Q14CN4 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
KRT72Q14CN4 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
KRT72Q14CN4 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
KRT72Q14CN4 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
KRT72Q14CN4 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
KRT72Q14CN4 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
KRT72Q14CN4 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
KRT72Q14CN4 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
KRT72Q14CN4 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
KRT72Q14CN4 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
KRT72Q14CN4 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
KRT72Q14CN4 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
KRT72Q14CN4 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
KRT72Q14CN4 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
KRT72Q14CN4 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
KRT72Q14CN4 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
KRT72Q14CN4 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
KRT72Q14CN4 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
KRT72Q14CN4 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
KRT72Q14CN4 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
KRT72Q14CN4 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 191.6 ms