Protein–RNA interactions for Protein: Q149N8

SHPRH, E3 ubiquitin-protein ligase SHPRH, humanhuman

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Length 1,683 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHPRHQ149N8 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
SHPRHQ149N8 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.95■■■□□ 2.55
SHPRHQ149N8 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC30.95■■■□□ 2.55
SHPRHQ149N8 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC30.95■■■□□ 2.55
SHPRHQ149N8 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC30.95■■■□□ 2.55
SHPRHQ149N8 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.54
SHPRHQ149N8 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.54
SHPRHQ149N8 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC30.95■■■□□ 2.54
SHPRHQ149N8 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
SHPRHQ149N8 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
SHPRHQ149N8 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
SHPRHQ149N8 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
SHPRHQ149N8 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC30.94■■■□□ 2.54
SHPRHQ149N8 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.93■■■□□ 2.54
SHPRHQ149N8 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.93■■■□□ 2.54
SHPRHQ149N8 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
SHPRHQ149N8 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC30.93■■■□□ 2.54
SHPRHQ149N8 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
SHPRHQ149N8 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
SHPRHQ149N8 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
SHPRHQ149N8 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.93■■■□□ 2.54
SHPRHQ149N8 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC30.93■■■□□ 2.54
SHPRHQ149N8 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.93■■■□□ 2.54
SHPRHQ149N8 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
SHPRHQ149N8 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
SHPRHQ149N8 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
SHPRHQ149N8 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
SHPRHQ149N8 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC30.92■■■□□ 2.54
SHPRHQ149N8 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC30.92■■■□□ 2.54
SHPRHQ149N8 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC30.92■■■□□ 2.54
SHPRHQ149N8 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
SHPRHQ149N8 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
SHPRHQ149N8 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC30.91■■■□□ 2.54
SHPRHQ149N8 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
SHPRHQ149N8 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
SHPRHQ149N8 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.91■■■□□ 2.54
SHPRHQ149N8 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC30.91■■■□□ 2.54
SHPRHQ149N8 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC30.91■■■□□ 2.54
SHPRHQ149N8 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC30.91■■■□□ 2.54
SHPRHQ149N8 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC30.91■■■□□ 2.54
SHPRHQ149N8 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
SHPRHQ149N8 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
SHPRHQ149N8 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC30.9■■■□□ 2.54
SHPRHQ149N8 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC30.9■■■□□ 2.54
SHPRHQ149N8 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
SHPRHQ149N8 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
SHPRHQ149N8 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
SHPRHQ149N8 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC30.9■■■□□ 2.54
SHPRHQ149N8 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC30.9■■■□□ 2.54
SHPRHQ149N8 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
SHPRHQ149N8 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
SHPRHQ149N8 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.89■■■□□ 2.54
SHPRHQ149N8 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
SHPRHQ149N8 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
SHPRHQ149N8 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC30.89■■■□□ 2.54
SHPRHQ149N8 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC30.89■■■□□ 2.54
SHPRHQ149N8 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
SHPRHQ149N8 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
SHPRHQ149N8 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
SHPRHQ149N8 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC30.88■■■□□ 2.53
SHPRHQ149N8 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC30.88■■■□□ 2.53
SHPRHQ149N8 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.88■■■□□ 2.53
SHPRHQ149N8 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
SHPRHQ149N8 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
SHPRHQ149N8 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
SHPRHQ149N8 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC30.87■■■□□ 2.53
SHPRHQ149N8 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC30.87■■■□□ 2.53
SHPRHQ149N8 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC30.87■■■□□ 2.53
SHPRHQ149N8 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC30.87■■■□□ 2.53
SHPRHQ149N8 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC30.87■■■□□ 2.53
SHPRHQ149N8 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC30.87■■■□□ 2.53
SHPRHQ149N8 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC30.87■■■□□ 2.53
SHPRHQ149N8 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC30.87■■■□□ 2.53
SHPRHQ149N8 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
SHPRHQ149N8 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
SHPRHQ149N8 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC30.87■■■□□ 2.53
SHPRHQ149N8 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
SHPRHQ149N8 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
SHPRHQ149N8 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
SHPRHQ149N8 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC30.86■■■□□ 2.53
SHPRHQ149N8 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
SHPRHQ149N8 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
SHPRHQ149N8 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
SHPRHQ149N8 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC30.85■■■□□ 2.53
SHPRHQ149N8 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC30.85■■■□□ 2.53
SHPRHQ149N8 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
SHPRHQ149N8 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.85■■■□□ 2.53
SHPRHQ149N8 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.85■■■□□ 2.53
SHPRHQ149N8 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC30.84■■■□□ 2.53
SHPRHQ149N8 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC30.84■■■□□ 2.53
SHPRHQ149N8 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC30.84■■■□□ 2.53
SHPRHQ149N8 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC30.84■■■□□ 2.53
SHPRHQ149N8 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC30.84■■■□□ 2.53
SHPRHQ149N8 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.84■■■□□ 2.53
SHPRHQ149N8 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC30.84■■■□□ 2.53
SHPRHQ149N8 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC30.84■■■□□ 2.53
SHPRHQ149N8 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC30.83■■■□□ 2.53
SHPRHQ149N8 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
SHPRHQ149N8 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
SHPRHQ149N8 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
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