Protein–RNA interactions for Protein: Q14151

SAFB2, Scaffold attachment factor B2, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 953 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAFB2Q14151 ATG10-207ENST00000513443 978 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.274e-7■□□□□ 9
SAFB2Q14151 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.144e-7■□□□□ 9
SAFB2Q14151 ATG10-203ENST00000458350 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.034e-7■□□□□ 9
SAFB2Q14151 ATG10-201ENST00000282185 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.194e-7■□□□□ 9
SAFB2Q14151 ATG10-204ENST00000504770 813 ntTSL 38.22□□□□□ -1.094e-7■□□□□ 9
SAFB2Q14151 ATG10-208ENST00000513634 618 ntTSL 2 BASIC8.22□□□□□ -1.094e-7■□□□□ 9
SAFB2Q14151 AC087235.1-201ENST00000538297 1329 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.074e-9■□□□□ 9
SAFB2Q14151 AC011476.3-201ENST00000593060 786 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.58e-7■□□□□ 8.9
SAFB2Q14151 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.872e-6■□□□□ 8.9
SAFB2Q14151 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC22.07■■□□□ 1.122e-6■□□□□ 8.9
SAFB2Q14151 KCNMB3-207ENST00000497599 1004 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.062e-6■□□□□ 8.9
SAFB2Q14151 LINC00969-267ENST00000626178 342 ntTSL 59.12□□□□□ -0.955e-9■□□□□ 8.9
SAFB2Q14151 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.226e-8■□□□□ 8.8
SAFB2Q14151 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.16e-8■□□□□ 8.8
SAFB2Q14151 TPTEP1-207ENST00000588424 1602 ntTSL 59.67□□□□□ -0.867e-10■□□□□ 8.8
SAFB2Q14151 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.897e-7■□□□□ 8.7
SAFB2Q14151 PDZD8-203ENST00000489302 740 ntTSL 314.84□□□□□ -0.037e-7■□□□□ 8.7
SAFB2Q14151 C20orf194-201ENST00000252032 6869 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.637e-7■□□□□ 8.7
SAFB2Q14151 PDZD8-202ENST00000482496 1400 ntTSL 24.48□□□□□ -1.697e-7■□□□□ 8.7
SAFB2Q14151 LINC01029-201ENST00000577408 1249 nt22.4■■□□□ 1.182e-8■□□□□ 8.7
SAFB2Q14151 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC31.06■■■□□ 2.567e-19■□□□□ 8.7
SAFB2Q14151 TMEM87A-205ENST00000562946 1430 ntTSL 212.7□□□□□ -0.381e-6■□□□□ 8.6
SAFB2Q14151 TMEM87A-203ENST00000448392 3049 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.571e-6■□□□□ 8.6
SAFB2Q14151 TMEM87A-202ENST00000389834 3109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.651e-6■□□□□ 8.6
SAFB2Q14151 TMEM87A-213ENST00000569075 1369 ntTSL 26.53□□□□□ -1.361e-6■□□□□ 8.6
SAFB2Q14151 TMEM87A-211ENST00000568400 905 ntTSL 36.4□□□□□ -1.381e-6■□□□□ 8.6
SAFB2Q14151 TMEM87A-206ENST00000563371 867 ntTSL 55.79□□□□□ -1.481e-6■□□□□ 8.6
SAFB2Q14151 TMEM87A-209ENST00000566474 581 ntTSL 45.28□□□□□ -1.561e-6■□□□□ 8.6
SAFB2Q14151 TMEM87A-204ENST00000561578 528 ntTSL 42.87□□□□□ -1.951e-6■□□□□ 8.6
SAFB2Q14151 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.53e-8■□□□□ 8.6
SAFB2Q14151 CCDC136-207ENST00000471729 495 ntTSL 314.09□□□□□ -0.151e-9■□□□□ 8.6
SAFB2Q14151 CEP192-212ENST00000540847 2485 ntTSL 215.34■□□□□ 0.051e-6■□□□□ 8.6
SAFB2Q14151 DLEU1-201ENST00000378180 981 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.011e-6■□□□□ 8.6
SAFB2Q14151 AC002384.1-201ENST00000490162 429 ntTSL 3 BASIC14.42□□□□□ -0.11e-6■□□□□ 8.6
SAFB2Q14151 AC002384.1-202ENST00000470135 673 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.431e-6■□□□□ 8.6
SAFB2Q14151 DLEU1-212ENST00000469754 2955 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.491e-6■□□□□ 8.6
SAFB2Q14151 LINC01687-203ENST00000420255 897 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.681e-6■□□□□ 8.6
SAFB2Q14151 CEP192-208ENST00000510237 6548 ntTSL 1 (best)10.74□□□□□ -0.691e-6■□□□□ 8.6
SAFB2Q14151 CEP192-207ENST00000508539 451 ntTSL 510.04□□□□□ -0.81e-6■□□□□ 8.6
SAFB2Q14151 CEP192-202ENST00000430049 3286 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.811e-6■□□□□ 8.6
SAFB2Q14151 CEP192-215ENST00000589993 3284 ntTSL 59.69□□□□□ -0.861e-6■□□□□ 8.6
SAFB2Q14151 AC002384.1-203ENST00000602761 3049 ntTSL 3 BASIC9.47□□□□□ -0.891e-6■□□□□ 8.6
SAFB2Q14151 CEP192-211ENST00000513432 8635 ntTSL 1 (best)8.53□□□□□ -1.041e-6■□□□□ 8.6
SAFB2Q14151 CEP192-209ENST00000511820 6455 ntTSL 1 (best)7.65□□□□□ -1.181e-6■□□□□ 8.6
SAFB2Q14151 RPL18P10-201ENST00000425606 538 ntBASIC6.91□□□□□ -1.31e-6■□□□□ 8.6
SAFB2Q14151 CEP192-203ENST00000506447 7960 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.22□□□□□ -1.411e-6■□□□□ 8.6
SAFB2Q14151 CEP192-201ENST00000325971 7764 ntTSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.481e-6■□□□□ 8.6
SAFB2Q14151 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.694e-8■□□□□ 8.5
SAFB2Q14151 SYNCRIP-203ENST00000444272 610 ntTSL 321.85■■□□□ 1.097e-11■□□□□ 8.5
SAFB2Q14151 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.857e-11■□□□□ 8.5
SAFB2Q14151 SYNCRIP-201ENST00000355238 6449 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.087e-11■□□□□ 8.5
SAFB2Q14151 AC004893.2-201ENST00000360902 3398 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.172e-6■□□□□ 8.5
SAFB2Q14151 CDK11A-216ENST00000479362 700 ntTSL 1 (best)14.5□□□□□ -0.093e-8■□□□□ 8.4
SAFB2Q14151 MED15-210ENST00000432052 598 ntTSL 430.37■■■□□ 2.452e-6■□□□□ 8.4
SAFB2Q14151 MED15-225ENST00000477824 571 ntTSL 530.29■■■□□ 2.442e-6■□□□□ 8.4
SAFB2Q14151 MED15-215ENST00000444094 551 ntTSL 428.53■■■□□ 2.162e-6■□□□□ 8.4
SAFB2Q14151 MED15-205ENST00000414658 717 ntTSL 327.04■■□□□ 1.922e-6■□□□□ 8.4
SAFB2Q14151 MED15-221ENST00000473028 556 ntTSL 425.44■■□□□ 1.662e-6■□□□□ 8.4
SAFB2Q14151 MED15-207ENST00000423862 581 ntTSL 325.21■■□□□ 1.632e-6■□□□□ 8.4
SAFB2Q14151 MED15-214ENST00000441501 840 ntTSL 324.64■■□□□ 1.542e-6■□□□□ 8.4
SAFB2Q14151 MED15-208ENST00000424287 589 ntTSL 423.51■■□□□ 1.352e-6■□□□□ 8.4
SAFB2Q14151 MED15-224ENST00000476767 590 ntTSL 423.51■■□□□ 1.352e-6■□□□□ 8.4
SAFB2Q14151 MED15-219ENST00000457322 623 ntTSL 423.45■■□□□ 1.342e-6■□□□□ 8.4
SAFB2Q14151 MED15-228ENST00000487550 587 ntTSL 322.75■■□□□ 1.232e-6■□□□□ 8.4
SAFB2Q14151 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.842e-6■□□□□ 8.4
SAFB2Q14151 MED15-204ENST00000406969 3210 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.692e-6■□□□□ 8.4
SAFB2Q14151 MED15-203ENST00000382974 2235 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.62e-6■□□□□ 8.4
SAFB2Q14151 MED15-211ENST00000433831 3267 ntTSL 518.25■□□□□ 0.512e-6■□□□□ 8.4
SAFB2Q14151 MED15-201ENST00000263205 3351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.352e-6■□□□□ 8.4
SAFB2Q14151 MED15-230ENST00000492381 3619 ntTSL 213.72□□□□□ -0.212e-6■□□□□ 8.4
SAFB2Q14151 MED15-209ENST00000428629 572 ntTSL 412.37□□□□□ -0.432e-6■□□□□ 8.4
SAFB2Q14151 AC011476.3-202ENST00000586845 553 ntTSL 3 BASIC8.72□□□□□ -1.012e-6■□□□□ 8.4
SAFB2Q14151 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC22.82■■□□□ 1.244e-8■□□□□ 8.4
SAFB2Q14151 PRPF38B-203ENST00000370025 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.295e-7■□□□□ 8.3
SAFB2Q14151 PRPF38B-201ENST00000370021 3728 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.35e-7■□□□□ 8.3
SAFB2Q14151 PIK3CB-204ENST00000462898 4747 ntTSL 522■■□□□ 1.113e-6■□□□□ 8.3
SAFB2Q14151 PIK3CB-208ENST00000477593 4658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.843e-6■□□□□ 8.3
SAFB2Q14151 PIK3CB-201ENST00000289153 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.043e-6■□□□□ 8.3
SAFB2Q14151 PIK3CB-203ENST00000462294 542 ntTSL 56.24□□□□□ -1.413e-6■□□□□ 8.3
SAFB2Q14151 AC063976.3-201ENST00000426849 329 ntBASIC4.01□□□□□ -1.773e-6■□□□□ 8.3
SAFB2Q14151 BRCA1-223ENST00000494123 1612 ntTSL 1 (best)20.59■□□□□ 0.893e-6■□□□□ 8.3
SAFB2Q14151 BRCA1-224ENST00000497488 779 ntTSL 1 (best)7.96□□□□□ -1.143e-6■□□□□ 8.3
SAFB2Q14151 BRCA1-220ENST00000492859 1584 ntTSL 1 (best)5.25□□□□□ -1.573e-6■□□□□ 8.3
SAFB2Q14151 ATR-201ENST00000350721 8249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.943e-6■□□□□ 8.3
SAFB2Q14151 GALNT5-201ENST00000259056 6171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.057e-8■□□□□ 8.2
SAFB2Q14151 HIRA-204ENST00000464189 560 ntTSL 416.62■□□□□ 0.256e-8■□□□□ 8.2
SAFB2Q14151 APC-206ENST00000507379 3602 ntTSL 217.55■□□□□ 0.44e-6■□□□□ 8.2
SAFB2Q14151 APC-210ENST00000512211 4061 ntTSL 24.63□□□□□ -1.674e-6■□□□□ 8.2
SAFB2Q14151 APC-202ENST00000502371 2630 ntTSL 1 (best)3.2□□□□□ -1.94e-6■□□□□ 8.2
SAFB2Q14151 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.793e-6■□□□□ 8.1
SAFB2Q14151 NFE4-202ENST00000638942 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.265e-9■□□□□ 8.1
SAFB2Q14151 AC135371.1-201ENST00000446964 453 ntTSL 2 BASIC4.54□□□□□ -1.683e-6■□□□□ 8.1
SAFB2Q14151 PRPF38B-205ENST00000485810 1352 ntTSL 24.93□□□□□ -1.624e-14■□□□□ 8.1
SAFB2Q14151 NKTR-201ENST00000232978 7343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.196e-9■□□□□ 8
SAFB2Q14151 NKTR-219ENST00000617821 7319 ntTSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.536e-9■□□□□ 8
SAFB2Q14151 NKTR-202ENST00000429888 7325 ntTSL 55.2□□□□□ -1.586e-9■□□□□ 8
Retrieved 96 of 3,296 protein–RNA pairs in 31.3 ms