Protein–RNA interactions for Protein: Q13740

ALCAM, CD166 antigen, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALCAMQ13740 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ALCAMQ13740 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ALCAMQ13740 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ALCAMQ13740 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ALCAMQ13740 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ALCAMQ13740 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
ALCAMQ13740 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ALCAMQ13740 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ALCAMQ13740 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ALCAMQ13740 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ALCAMQ13740 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ALCAMQ13740 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ALCAMQ13740 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ALCAMQ13740 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ALCAMQ13740 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ALCAMQ13740 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ALCAMQ13740 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ALCAMQ13740 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ALCAMQ13740 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ALCAMQ13740 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ALCAMQ13740 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ALCAMQ13740 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ALCAMQ13740 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ALCAMQ13740 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ALCAMQ13740 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ALCAMQ13740 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
ALCAMQ13740 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ALCAMQ13740 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ALCAMQ13740 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ALCAMQ13740 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ALCAMQ13740 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ALCAMQ13740 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ALCAMQ13740 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ALCAMQ13740 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ALCAMQ13740 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ALCAMQ13740 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ALCAMQ13740 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ALCAMQ13740 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ALCAMQ13740 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ALCAMQ13740 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ALCAMQ13740 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ALCAMQ13740 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ALCAMQ13740 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ALCAMQ13740 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
ALCAMQ13740 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ALCAMQ13740 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ALCAMQ13740 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
ALCAMQ13740 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ALCAMQ13740 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ALCAMQ13740 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ALCAMQ13740 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ALCAMQ13740 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ALCAMQ13740 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ALCAMQ13740 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ALCAMQ13740 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ALCAMQ13740 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ALCAMQ13740 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ALCAMQ13740 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ALCAMQ13740 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ALCAMQ13740 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ALCAMQ13740 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ALCAMQ13740 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ALCAMQ13740 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ALCAMQ13740 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ALCAMQ13740 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ALCAMQ13740 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ALCAMQ13740 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ALCAMQ13740 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ALCAMQ13740 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
ALCAMQ13740 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ALCAMQ13740 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ALCAMQ13740 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ALCAMQ13740 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ALCAMQ13740 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ALCAMQ13740 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ALCAMQ13740 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ALCAMQ13740 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ALCAMQ13740 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ALCAMQ13740 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
ALCAMQ13740 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ALCAMQ13740 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
ALCAMQ13740 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ALCAMQ13740 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ALCAMQ13740 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ALCAMQ13740 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ALCAMQ13740 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ALCAMQ13740 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ALCAMQ13740 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ALCAMQ13740 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ALCAMQ13740 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ALCAMQ13740 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ALCAMQ13740 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ALCAMQ13740 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ALCAMQ13740 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ALCAMQ13740 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ALCAMQ13740 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ALCAMQ13740 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ALCAMQ13740 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ALCAMQ13740 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ALCAMQ13740 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
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