Protein–RNA interactions for Protein: Q13496

MTM1, Myotubularin, humanhuman

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Length 603 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTM1Q13496 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MTM1Q13496 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MTM1Q13496 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MTM1Q13496 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MTM1Q13496 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MTM1Q13496 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MTM1Q13496 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MTM1Q13496 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MTM1Q13496 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MTM1Q13496 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MTM1Q13496 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MTM1Q13496 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MTM1Q13496 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MTM1Q13496 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
MTM1Q13496 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MTM1Q13496 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
MTM1Q13496 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
MTM1Q13496 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MTM1Q13496 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
MTM1Q13496 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
MTM1Q13496 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MTM1Q13496 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MTM1Q13496 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MTM1Q13496 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
MTM1Q13496 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
MTM1Q13496 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MTM1Q13496 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MTM1Q13496 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MTM1Q13496 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MTM1Q13496 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
MTM1Q13496 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MTM1Q13496 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
MTM1Q13496 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MTM1Q13496 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MTM1Q13496 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MTM1Q13496 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MTM1Q13496 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MTM1Q13496 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MTM1Q13496 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MTM1Q13496 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MTM1Q13496 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MTM1Q13496 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MTM1Q13496 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MTM1Q13496 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MTM1Q13496 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MTM1Q13496 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MTM1Q13496 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MTM1Q13496 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MTM1Q13496 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MTM1Q13496 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MTM1Q13496 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MTM1Q13496 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MTM1Q13496 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
MTM1Q13496 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
MTM1Q13496 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
MTM1Q13496 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MTM1Q13496 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MTM1Q13496 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
MTM1Q13496 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MTM1Q13496 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
MTM1Q13496 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MTM1Q13496 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MTM1Q13496 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MTM1Q13496 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
MTM1Q13496 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
MTM1Q13496 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MTM1Q13496 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
MTM1Q13496 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
MTM1Q13496 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.23
MTM1Q13496 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
MTM1Q13496 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MTM1Q13496 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MTM1Q13496 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MTM1Q13496 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MTM1Q13496 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MTM1Q13496 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MTM1Q13496 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MTM1Q13496 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MTM1Q13496 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MTM1Q13496 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MTM1Q13496 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MTM1Q13496 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MTM1Q13496 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MTM1Q13496 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MTM1Q13496 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MTM1Q13496 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
MTM1Q13496 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MTM1Q13496 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MTM1Q13496 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MTM1Q13496 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MTM1Q13496 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MTM1Q13496 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MTM1Q13496 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MTM1Q13496 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MTM1Q13496 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MTM1Q13496 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MTM1Q13496 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MTM1Q13496 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MTM1Q13496 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MTM1Q13496 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
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