Protein–RNA interactions for Protein: Q13136

PPFIA1, Liprin-alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPFIA1Q13136 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PPFIA1Q13136 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PPFIA1Q13136 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
PPFIA1Q13136 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PPFIA1Q13136 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PPFIA1Q13136 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PPFIA1Q13136 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PPFIA1Q13136 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PPFIA1Q13136 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PPFIA1Q13136 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PPFIA1Q13136 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PPFIA1Q13136 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
PPFIA1Q13136 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PPFIA1Q13136 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PPFIA1Q13136 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PPFIA1Q13136 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PPFIA1Q13136 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
PPFIA1Q13136 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
PPFIA1Q13136 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PPFIA1Q13136 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PPFIA1Q13136 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PPFIA1Q13136 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
PPFIA1Q13136 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PPFIA1Q13136 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PPFIA1Q13136 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
PPFIA1Q13136 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PPFIA1Q13136 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PPFIA1Q13136 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PPFIA1Q13136 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PPFIA1Q13136 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PPFIA1Q13136 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PPFIA1Q13136 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PPFIA1Q13136 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
PPFIA1Q13136 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PPFIA1Q13136 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PPFIA1Q13136 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PPFIA1Q13136 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PPFIA1Q13136 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PPFIA1Q13136 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PPFIA1Q13136 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
PPFIA1Q13136 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PPFIA1Q13136 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PPFIA1Q13136 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PPFIA1Q13136 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PPFIA1Q13136 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PPFIA1Q13136 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PPFIA1Q13136 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PPFIA1Q13136 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PPFIA1Q13136 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PPFIA1Q13136 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PPFIA1Q13136 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PPFIA1Q13136 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PPFIA1Q13136 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PPFIA1Q13136 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PPFIA1Q13136 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PPFIA1Q13136 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PPFIA1Q13136 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PPFIA1Q13136 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PPFIA1Q13136 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PPFIA1Q13136 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PPFIA1Q13136 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PPFIA1Q13136 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PPFIA1Q13136 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PPFIA1Q13136 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PPFIA1Q13136 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PPFIA1Q13136 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PPFIA1Q13136 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
PPFIA1Q13136 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PPFIA1Q13136 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
PPFIA1Q13136 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PPFIA1Q13136 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PPFIA1Q13136 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PPFIA1Q13136 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PPFIA1Q13136 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PPFIA1Q13136 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PPFIA1Q13136 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PPFIA1Q13136 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PPFIA1Q13136 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PPFIA1Q13136 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PPFIA1Q13136 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PPFIA1Q13136 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PPFIA1Q13136 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PPFIA1Q13136 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PPFIA1Q13136 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PPFIA1Q13136 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PPFIA1Q13136 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PPFIA1Q13136 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PPFIA1Q13136 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PPFIA1Q13136 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
PPFIA1Q13136 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
PPFIA1Q13136 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PPFIA1Q13136 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PPFIA1Q13136 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PPFIA1Q13136 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PPFIA1Q13136 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PPFIA1Q13136 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PPFIA1Q13136 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PPFIA1Q13136 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PPFIA1Q13136 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PPFIA1Q13136 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms