Protein–RNA interactions for Protein: Q12946

FOXF1, Forkhead box protein F1, humanhuman

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Length 379 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXF1Q12946 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
FOXF1Q12946 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
FOXF1Q12946 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
FOXF1Q12946 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
FOXF1Q12946 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
FOXF1Q12946 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
FOXF1Q12946 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
FOXF1Q12946 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
FOXF1Q12946 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
FOXF1Q12946 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
FOXF1Q12946 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
FOXF1Q12946 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
FOXF1Q12946 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
FOXF1Q12946 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
FOXF1Q12946 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
FOXF1Q12946 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
FOXF1Q12946 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
FOXF1Q12946 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
FOXF1Q12946 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
FOXF1Q12946 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
FOXF1Q12946 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
FOXF1Q12946 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
FOXF1Q12946 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
FOXF1Q12946 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
FOXF1Q12946 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
FOXF1Q12946 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
FOXF1Q12946 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
FOXF1Q12946 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
FOXF1Q12946 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
FOXF1Q12946 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
FOXF1Q12946 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
FOXF1Q12946 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
FOXF1Q12946 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
FOXF1Q12946 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
FOXF1Q12946 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
FOXF1Q12946 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
FOXF1Q12946 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
FOXF1Q12946 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
FOXF1Q12946 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
FOXF1Q12946 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
FOXF1Q12946 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
FOXF1Q12946 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
FOXF1Q12946 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
FOXF1Q12946 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
FOXF1Q12946 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
FOXF1Q12946 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
FOXF1Q12946 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
FOXF1Q12946 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
FOXF1Q12946 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
FOXF1Q12946 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
FOXF1Q12946 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
FOXF1Q12946 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
FOXF1Q12946 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
FOXF1Q12946 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
FOXF1Q12946 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
FOXF1Q12946 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
FOXF1Q12946 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
FOXF1Q12946 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
FOXF1Q12946 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
FOXF1Q12946 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
FOXF1Q12946 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
FOXF1Q12946 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
FOXF1Q12946 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
FOXF1Q12946 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
FOXF1Q12946 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
FOXF1Q12946 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
FOXF1Q12946 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
FOXF1Q12946 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
FOXF1Q12946 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
FOXF1Q12946 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
FOXF1Q12946 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
FOXF1Q12946 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
FOXF1Q12946 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
FOXF1Q12946 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
FOXF1Q12946 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
FOXF1Q12946 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
FOXF1Q12946 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
FOXF1Q12946 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
FOXF1Q12946 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
FOXF1Q12946 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
FOXF1Q12946 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
FOXF1Q12946 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
FOXF1Q12946 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
FOXF1Q12946 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
FOXF1Q12946 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
FOXF1Q12946 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
FOXF1Q12946 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
FOXF1Q12946 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
FOXF1Q12946 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC20.02■□□□□ 0.79
FOXF1Q12946 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
FOXF1Q12946 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
FOXF1Q12946 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
FOXF1Q12946 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
FOXF1Q12946 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
FOXF1Q12946 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
FOXF1Q12946 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
FOXF1Q12946 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
FOXF1Q12946 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
FOXF1Q12946 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
FOXF1Q12946 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
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