Protein–RNA interactions for Protein: Q0PNE2

ELP6, Elongator complex protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ELP6Q0PNE2 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ELP6Q0PNE2 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ELP6Q0PNE2 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ELP6Q0PNE2 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ELP6Q0PNE2 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ELP6Q0PNE2 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ELP6Q0PNE2 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ELP6Q0PNE2 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ELP6Q0PNE2 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
ELP6Q0PNE2 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
ELP6Q0PNE2 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ELP6Q0PNE2 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ELP6Q0PNE2 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ELP6Q0PNE2 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ELP6Q0PNE2 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ELP6Q0PNE2 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ELP6Q0PNE2 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
ELP6Q0PNE2 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
ELP6Q0PNE2 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ELP6Q0PNE2 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ELP6Q0PNE2 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ELP6Q0PNE2 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ELP6Q0PNE2 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ELP6Q0PNE2 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ELP6Q0PNE2 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ELP6Q0PNE2 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ELP6Q0PNE2 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ELP6Q0PNE2 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ELP6Q0PNE2 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ELP6Q0PNE2 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ELP6Q0PNE2 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ELP6Q0PNE2 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ELP6Q0PNE2 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ELP6Q0PNE2 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ELP6Q0PNE2 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ELP6Q0PNE2 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ELP6Q0PNE2 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ELP6Q0PNE2 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ELP6Q0PNE2 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ELP6Q0PNE2 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ELP6Q0PNE2 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ELP6Q0PNE2 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
ELP6Q0PNE2 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ELP6Q0PNE2 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ELP6Q0PNE2 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ELP6Q0PNE2 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ELP6Q0PNE2 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ELP6Q0PNE2 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ELP6Q0PNE2 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ELP6Q0PNE2 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ELP6Q0PNE2 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ELP6Q0PNE2 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ELP6Q0PNE2 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ELP6Q0PNE2 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ELP6Q0PNE2 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ELP6Q0PNE2 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ELP6Q0PNE2 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ELP6Q0PNE2 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ELP6Q0PNE2 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ELP6Q0PNE2 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ELP6Q0PNE2 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ELP6Q0PNE2 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ELP6Q0PNE2 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ELP6Q0PNE2 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ELP6Q0PNE2 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
ELP6Q0PNE2 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
ELP6Q0PNE2 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
ELP6Q0PNE2 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
ELP6Q0PNE2 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
ELP6Q0PNE2 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ELP6Q0PNE2 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ELP6Q0PNE2 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ELP6Q0PNE2 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
ELP6Q0PNE2 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ELP6Q0PNE2 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ELP6Q0PNE2 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ELP6Q0PNE2 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ELP6Q0PNE2 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ELP6Q0PNE2 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
ELP6Q0PNE2 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ELP6Q0PNE2 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ELP6Q0PNE2 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ELP6Q0PNE2 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ELP6Q0PNE2 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ELP6Q0PNE2 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ELP6Q0PNE2 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ELP6Q0PNE2 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ELP6Q0PNE2 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ELP6Q0PNE2 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ELP6Q0PNE2 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ELP6Q0PNE2 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ELP6Q0PNE2 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ELP6Q0PNE2 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ELP6Q0PNE2 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ELP6Q0PNE2 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
ELP6Q0PNE2 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ELP6Q0PNE2 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
ELP6Q0PNE2 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ELP6Q0PNE2 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ELP6Q0PNE2 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.4 ms