Protein–RNA interactions for Protein: Q09161

NCBP1, Nuclear cap-binding protein subunit 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 790 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCBP1Q09161 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
NCBP1Q09161 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NCBP1Q09161 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
NCBP1Q09161 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NCBP1Q09161 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
NCBP1Q09161 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
NCBP1Q09161 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
NCBP1Q09161 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
NCBP1Q09161 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
NCBP1Q09161 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
NCBP1Q09161 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
NCBP1Q09161 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
NCBP1Q09161 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC24.93■■□□□ 1.58
NCBP1Q09161 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
NCBP1Q09161 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
NCBP1Q09161 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
NCBP1Q09161 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
NCBP1Q09161 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
NCBP1Q09161 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
NCBP1Q09161 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
NCBP1Q09161 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
NCBP1Q09161 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
NCBP1Q09161 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
NCBP1Q09161 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
NCBP1Q09161 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
NCBP1Q09161 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
NCBP1Q09161 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
NCBP1Q09161 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
NCBP1Q09161 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
NCBP1Q09161 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
NCBP1Q09161 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
NCBP1Q09161 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
NCBP1Q09161 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
NCBP1Q09161 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
NCBP1Q09161 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
NCBP1Q09161 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
NCBP1Q09161 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NCBP1Q09161 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NCBP1Q09161 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
NCBP1Q09161 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NCBP1Q09161 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
NCBP1Q09161 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NCBP1Q09161 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NCBP1Q09161 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NCBP1Q09161 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
NCBP1Q09161 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
NCBP1Q09161 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
NCBP1Q09161 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
NCBP1Q09161 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
NCBP1Q09161 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
NCBP1Q09161 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
NCBP1Q09161 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
NCBP1Q09161 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
NCBP1Q09161 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
NCBP1Q09161 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
NCBP1Q09161 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
NCBP1Q09161 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC24.89■■□□□ 1.57
NCBP1Q09161 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
NCBP1Q09161 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NCBP1Q09161 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
NCBP1Q09161 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
NCBP1Q09161 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NCBP1Q09161 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
NCBP1Q09161 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
NCBP1Q09161 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
NCBP1Q09161 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
NCBP1Q09161 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
NCBP1Q09161 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
NCBP1Q09161 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NCBP1Q09161 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NCBP1Q09161 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
NCBP1Q09161 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
NCBP1Q09161 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
NCBP1Q09161 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
NCBP1Q09161 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
NCBP1Q09161 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
NCBP1Q09161 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
NCBP1Q09161 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
NCBP1Q09161 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
NCBP1Q09161 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
NCBP1Q09161 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
NCBP1Q09161 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
NCBP1Q09161 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
NCBP1Q09161 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NCBP1Q09161 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NCBP1Q09161 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NCBP1Q09161 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NCBP1Q09161 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
NCBP1Q09161 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
NCBP1Q09161 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NCBP1Q09161 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NCBP1Q09161 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
NCBP1Q09161 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NCBP1Q09161 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NCBP1Q09161 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NCBP1Q09161 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
NCBP1Q09161 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NCBP1Q09161 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NCBP1Q09161 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NCBP1Q09161 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms