Protein–RNA interactions for Protein: Q08722

CD47, Leukocyte surface antigen CD47, humanhuman

Predictions only

Length 323 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD47Q08722 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CD47Q08722 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CD47Q08722 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CD47Q08722 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CD47Q08722 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CD47Q08722 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CD47Q08722 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CD47Q08722 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CD47Q08722 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CD47Q08722 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CD47Q08722 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CD47Q08722 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CD47Q08722 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CD47Q08722 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CD47Q08722 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CD47Q08722 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CD47Q08722 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CD47Q08722 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CD47Q08722 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CD47Q08722 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CD47Q08722 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CD47Q08722 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CD47Q08722 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CD47Q08722 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CD47Q08722 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CD47Q08722 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CD47Q08722 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CD47Q08722 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CD47Q08722 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CD47Q08722 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CD47Q08722 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CD47Q08722 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CD47Q08722 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
CD47Q08722 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
CD47Q08722 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CD47Q08722 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CD47Q08722 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CD47Q08722 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CD47Q08722 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CD47Q08722 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CD47Q08722 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CD47Q08722 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CD47Q08722 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CD47Q08722 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CD47Q08722 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CD47Q08722 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CD47Q08722 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CD47Q08722 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
CD47Q08722 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CD47Q08722 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CD47Q08722 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CD47Q08722 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CD47Q08722 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CD47Q08722 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CD47Q08722 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CD47Q08722 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
CD47Q08722 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CD47Q08722 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CD47Q08722 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CD47Q08722 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CD47Q08722 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CD47Q08722 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CD47Q08722 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CD47Q08722 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CD47Q08722 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
CD47Q08722 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CD47Q08722 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CD47Q08722 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CD47Q08722 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CD47Q08722 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
CD47Q08722 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CD47Q08722 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CD47Q08722 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CD47Q08722 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CD47Q08722 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
CD47Q08722 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CD47Q08722 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CD47Q08722 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CD47Q08722 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CD47Q08722 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CD47Q08722 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CD47Q08722 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
CD47Q08722 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CD47Q08722 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CD47Q08722 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CD47Q08722 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CD47Q08722 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CD47Q08722 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CD47Q08722 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
CD47Q08722 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CD47Q08722 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CD47Q08722 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CD47Q08722 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CD47Q08722 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CD47Q08722 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CD47Q08722 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CD47Q08722 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CD47Q08722 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CD47Q08722 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CD47Q08722 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms