Protein–RNA interactions for Protein: Q08174

PCDH1, Protocadherin-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,060 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCDH1Q08174 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PCDH1Q08174 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PCDH1Q08174 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
PCDH1Q08174 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PCDH1Q08174 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PCDH1Q08174 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PCDH1Q08174 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PCDH1Q08174 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
PCDH1Q08174 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PCDH1Q08174 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PCDH1Q08174 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PCDH1Q08174 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PCDH1Q08174 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PCDH1Q08174 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PCDH1Q08174 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PCDH1Q08174 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PCDH1Q08174 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PCDH1Q08174 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PCDH1Q08174 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PCDH1Q08174 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PCDH1Q08174 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PCDH1Q08174 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PCDH1Q08174 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PCDH1Q08174 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PCDH1Q08174 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
PCDH1Q08174 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PCDH1Q08174 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PCDH1Q08174 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PCDH1Q08174 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PCDH1Q08174 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PCDH1Q08174 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PCDH1Q08174 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
PCDH1Q08174 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PCDH1Q08174 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1
PCDH1Q08174 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
PCDH1Q08174 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
PCDH1Q08174 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
PCDH1Q08174 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
PCDH1Q08174 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
PCDH1Q08174 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
PCDH1Q08174 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PCDH1Q08174 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PCDH1Q08174 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PCDH1Q08174 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PCDH1Q08174 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PCDH1Q08174 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PCDH1Q08174 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
PCDH1Q08174 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PCDH1Q08174 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
PCDH1Q08174 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC21.32■■□□□ 1
PCDH1Q08174 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PCDH1Q08174 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
PCDH1Q08174 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PCDH1Q08174 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
PCDH1Q08174 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
PCDH1Q08174 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC21.32■■□□□ 1
PCDH1Q08174 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PCDH1Q08174 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
PCDH1Q08174 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
PCDH1Q08174 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC21.31■■□□□ 1
PCDH1Q08174 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
PCDH1Q08174 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC21.31■■□□□ 1
PCDH1Q08174 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
PCDH1Q08174 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC21.31■■□□□ 1
PCDH1Q08174 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
PCDH1Q08174 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
PCDH1Q08174 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PCDH1Q08174 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PCDH1Q08174 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
PCDH1Q08174 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PCDH1Q08174 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
PCDH1Q08174 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PCDH1Q08174 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
PCDH1Q08174 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PCDH1Q08174 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PCDH1Q08174 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PCDH1Q08174 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
PCDH1Q08174 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC21.3■■□□□ 1
PCDH1Q08174 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
PCDH1Q08174 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
PCDH1Q08174 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PCDH1Q08174 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PCDH1Q08174 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
PCDH1Q08174 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
PCDH1Q08174 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PCDH1Q08174 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PCDH1Q08174 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PCDH1Q08174 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PCDH1Q08174 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PCDH1Q08174 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PCDH1Q08174 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PCDH1Q08174 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
PCDH1Q08174 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
PCDH1Q08174 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
PCDH1Q08174 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PCDH1Q08174 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PCDH1Q08174 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PCDH1Q08174 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC21.29■■□□□ 1
PCDH1Q08174 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PCDH1Q08174 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms