Protein–RNA interactions for Protein: Q08050

FOXM1, Forkhead box protein M1, humanhuman

Predictions only

Length 763 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXM1Q08050 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
FOXM1Q08050 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
FOXM1Q08050 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
FOXM1Q08050 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
FOXM1Q08050 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
FOXM1Q08050 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
FOXM1Q08050 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
FOXM1Q08050 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
FOXM1Q08050 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
FOXM1Q08050 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
FOXM1Q08050 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
FOXM1Q08050 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
FOXM1Q08050 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
FOXM1Q08050 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
FOXM1Q08050 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
FOXM1Q08050 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
FOXM1Q08050 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
FOXM1Q08050 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
FOXM1Q08050 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
FOXM1Q08050 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
FOXM1Q08050 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
FOXM1Q08050 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
FOXM1Q08050 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
FOXM1Q08050 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
FOXM1Q08050 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
FOXM1Q08050 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
FOXM1Q08050 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
FOXM1Q08050 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
FOXM1Q08050 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
FOXM1Q08050 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
FOXM1Q08050 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
FOXM1Q08050 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
FOXM1Q08050 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
FOXM1Q08050 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
FOXM1Q08050 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
FOXM1Q08050 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
FOXM1Q08050 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
FOXM1Q08050 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
FOXM1Q08050 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
FOXM1Q08050 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
FOXM1Q08050 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
FOXM1Q08050 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
FOXM1Q08050 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
FOXM1Q08050 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
FOXM1Q08050 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
FOXM1Q08050 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
FOXM1Q08050 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
FOXM1Q08050 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
FOXM1Q08050 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
FOXM1Q08050 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
FOXM1Q08050 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
FOXM1Q08050 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
FOXM1Q08050 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
FOXM1Q08050 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
FOXM1Q08050 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
FOXM1Q08050 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
FOXM1Q08050 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
FOXM1Q08050 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
FOXM1Q08050 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
FOXM1Q08050 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
FOXM1Q08050 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
FOXM1Q08050 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.07
FOXM1Q08050 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
FOXM1Q08050 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
FOXM1Q08050 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
FOXM1Q08050 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
FOXM1Q08050 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
FOXM1Q08050 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
FOXM1Q08050 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
FOXM1Q08050 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
FOXM1Q08050 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
FOXM1Q08050 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
FOXM1Q08050 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
FOXM1Q08050 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
FOXM1Q08050 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
FOXM1Q08050 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
FOXM1Q08050 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
FOXM1Q08050 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
FOXM1Q08050 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
FOXM1Q08050 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
FOXM1Q08050 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
FOXM1Q08050 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
FOXM1Q08050 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
FOXM1Q08050 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
FOXM1Q08050 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
FOXM1Q08050 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
FOXM1Q08050 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
FOXM1Q08050 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
FOXM1Q08050 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
FOXM1Q08050 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
FOXM1Q08050 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
FOXM1Q08050 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
FOXM1Q08050 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
FOXM1Q08050 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
FOXM1Q08050 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
FOXM1Q08050 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
FOXM1Q08050 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
FOXM1Q08050 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
FOXM1Q08050 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
FOXM1Q08050 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms