Protein–RNA interactions for Protein: Q06828

FMOD, Fibromodulin, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FMODQ06828 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
FMODQ06828 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
FMODQ06828 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
FMODQ06828 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
FMODQ06828 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
FMODQ06828 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC19.67■□□□□ 0.74
FMODQ06828 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
FMODQ06828 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
FMODQ06828 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
FMODQ06828 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC19.66■□□□□ 0.74
FMODQ06828 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
FMODQ06828 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
FMODQ06828 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
FMODQ06828 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
FMODQ06828 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
FMODQ06828 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC19.66■□□□□ 0.74
FMODQ06828 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
FMODQ06828 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
FMODQ06828 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
FMODQ06828 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
FMODQ06828 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC19.66■□□□□ 0.74
FMODQ06828 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
FMODQ06828 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
FMODQ06828 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
FMODQ06828 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
FMODQ06828 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
FMODQ06828 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
FMODQ06828 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
FMODQ06828 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
FMODQ06828 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
FMODQ06828 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
FMODQ06828 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
FMODQ06828 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
FMODQ06828 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
FMODQ06828 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.65■□□□□ 0.74
FMODQ06828 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
FMODQ06828 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC19.65■□□□□ 0.74
FMODQ06828 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
FMODQ06828 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
FMODQ06828 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
FMODQ06828 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC19.64■□□□□ 0.74
FMODQ06828 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
FMODQ06828 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
FMODQ06828 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
FMODQ06828 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
FMODQ06828 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
FMODQ06828 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
FMODQ06828 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
FMODQ06828 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
FMODQ06828 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
FMODQ06828 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
FMODQ06828 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
FMODQ06828 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
FMODQ06828 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
FMODQ06828 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
FMODQ06828 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
FMODQ06828 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
FMODQ06828 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
FMODQ06828 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
FMODQ06828 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
FMODQ06828 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
FMODQ06828 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
FMODQ06828 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
FMODQ06828 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
FMODQ06828 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
FMODQ06828 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
FMODQ06828 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
FMODQ06828 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
FMODQ06828 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
FMODQ06828 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
FMODQ06828 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
FMODQ06828 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
FMODQ06828 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
FMODQ06828 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
FMODQ06828 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
FMODQ06828 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
FMODQ06828 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
FMODQ06828 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
FMODQ06828 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
FMODQ06828 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
FMODQ06828 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
FMODQ06828 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
FMODQ06828 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
FMODQ06828 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
FMODQ06828 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
FMODQ06828 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
FMODQ06828 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
FMODQ06828 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
FMODQ06828 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
FMODQ06828 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
FMODQ06828 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC19.61■□□□□ 0.73
FMODQ06828 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
FMODQ06828 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
FMODQ06828 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
FMODQ06828 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
FMODQ06828 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
FMODQ06828 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
FMODQ06828 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
FMODQ06828 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
FMODQ06828 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms