Protein–RNA interactions for Protein: Q03721

KCNC4, Potassium voltage-gated channel subfamily C member 4, humanhuman

Predictions only

Length 635 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNC4Q03721 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
KCNC4Q03721 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
KCNC4Q03721 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
KCNC4Q03721 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
KCNC4Q03721 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
KCNC4Q03721 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
KCNC4Q03721 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
KCNC4Q03721 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
KCNC4Q03721 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
KCNC4Q03721 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
KCNC4Q03721 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
KCNC4Q03721 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
KCNC4Q03721 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
KCNC4Q03721 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
KCNC4Q03721 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
KCNC4Q03721 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
KCNC4Q03721 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
KCNC4Q03721 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
KCNC4Q03721 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
KCNC4Q03721 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
KCNC4Q03721 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
KCNC4Q03721 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
KCNC4Q03721 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
KCNC4Q03721 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
KCNC4Q03721 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
KCNC4Q03721 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
KCNC4Q03721 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
KCNC4Q03721 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
KCNC4Q03721 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
KCNC4Q03721 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
KCNC4Q03721 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
KCNC4Q03721 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
KCNC4Q03721 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
KCNC4Q03721 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
KCNC4Q03721 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
KCNC4Q03721 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
KCNC4Q03721 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC21.22■□□□□ 0.99
KCNC4Q03721 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
KCNC4Q03721 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
KCNC4Q03721 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
KCNC4Q03721 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
KCNC4Q03721 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
KCNC4Q03721 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
KCNC4Q03721 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
KCNC4Q03721 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
KCNC4Q03721 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
KCNC4Q03721 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
KCNC4Q03721 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
KCNC4Q03721 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
KCNC4Q03721 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
KCNC4Q03721 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
KCNC4Q03721 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
KCNC4Q03721 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
KCNC4Q03721 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
KCNC4Q03721 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
KCNC4Q03721 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
KCNC4Q03721 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
KCNC4Q03721 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
KCNC4Q03721 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
KCNC4Q03721 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
KCNC4Q03721 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
KCNC4Q03721 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
KCNC4Q03721 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
KCNC4Q03721 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC21.2■□□□□ 0.98
KCNC4Q03721 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
KCNC4Q03721 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
KCNC4Q03721 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
KCNC4Q03721 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
KCNC4Q03721 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
KCNC4Q03721 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
KCNC4Q03721 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
KCNC4Q03721 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
KCNC4Q03721 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
KCNC4Q03721 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
KCNC4Q03721 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
KCNC4Q03721 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
KCNC4Q03721 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
KCNC4Q03721 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
KCNC4Q03721 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
KCNC4Q03721 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
KCNC4Q03721 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
KCNC4Q03721 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
KCNC4Q03721 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
KCNC4Q03721 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
KCNC4Q03721 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
KCNC4Q03721 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
KCNC4Q03721 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
KCNC4Q03721 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
KCNC4Q03721 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
KCNC4Q03721 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
KCNC4Q03721 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
KCNC4Q03721 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
KCNC4Q03721 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
KCNC4Q03721 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
KCNC4Q03721 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
KCNC4Q03721 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC21.18■□□□□ 0.98
KCNC4Q03721 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
KCNC4Q03721 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
KCNC4Q03721 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
KCNC4Q03721 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms